<div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">- use Ralf&#39;s minimal covering sphere algorithm to pack everything together (Ralf: is it in svn?)</blockquote>
<div><br></div><div>No. I found this to be a tricky problem. My implementation was just good enough for a specific purpose. I&#39;m attaching the old script just in case it is useful as a starting point. Probably it doesn&#39;t run without modifications. It aims to move protein chains around minimizing the radius of the covering sphere. It isn&#39;t always what one would choose after visual inspection. The conformational search isn&#39;t exhaustive.</div>
<div>Ralf</div><div><br></div><div>�</div></div>