<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 12pt;
font-family:Calibri
}
--></style></head>
<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>Sorry, yes,'global_' is also a special global data block and should work...<br><br><div><div id="SkyDrivePlaceholder"></div><hr id="stopSpelling">From: nechols@lbl.gov<br>Date: Wed, 10 Apr 2013 16:17:53 -0700<br>To: cctbxbb@phenix-online.org<br>Subject: Re: [cctbxbb] cif parser &amp; ccp4 mon_lib incompatibility<br><br><div dir="ltr"><div class="ecxgmail_extra">On Wed, Apr 10, 2013 at 4:12 PM, Oleg Dolomanov <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:oleg@olexsys.org" target="_blank">oleg@olexsys.org</a>&gt;</span> wrote:<br><div class="ecxgmail_quote">

<blockquote class="ecxgmail_quote" style="border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex;">


<div><div dir="ltr"><div>the CIF parser will report this error if any of the CIF items is outside data_ or save_ blocks. So you need to change 'global' to 'data_global' to prevent this error.</div></div></div>

</blockquote><div><br></div><div>This would be true when using the CIF reader on its own, but for macromolecular apps (including the test script that's failing), we disable this error checking specifically for the CCP4 monomer library. &nbsp;In fact the version we distribute with Phenix ($PHENIX/chem_data/mon_lib/list/mon_lib_list.cif) starts like this:</div>

<div><div><br></div><div>global_</div><div>_lib_name &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; mon_lib</div><div>_lib_version &nbsp; &nbsp; &nbsp;4.11</div><div>_lib_update &nbsp; &nbsp; &nbsp; 15/04/05</div><div><br></div><div>It is very likely that we may start to distribute the entire chem_data tree from our web site as an optional add-on, which will greatly ease the use of CCTBX in other macromolecular applications (e.g. MolProbity). &nbsp;Of course the CCP4 version will be more complete and up-to-date, although a) some of those restraints are not especially well-validated, and b) we incorporate additional information in the restraints we distribute.</div>

<div><br></div><div>-Nat</div></div></div></div></div>
<br>_______________________________________________
cctbxbb mailing list
cctbxbb@phenix-online.org
http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb</div>                                               </div></body>
</html>