<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>Since wxPython was updated to 3.0.2, I have been thinking about updating the other GUI-related packages to more recent versions. I would probably update to the latest, stable version that does not involve major changes to the API so that backwards compatibility is preserved. Let me know if that would be helpful and I can prioritize the migration and testing.</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div>--</div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Billy K. Poon</span><br></div></div><div>Research Scientist, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging</div><div>Lawrence Berkeley National Laboratory</div><div>1 Cyclotron Road, M/S 33R0345</div><div>Berkeley, CA 94720</div><div>Tel: (510) 486-5709</div><div>Fax: (510) 486-5909</div><div>Web: <a href="https://phenix-online.org" target="_blank">https://phenix-online.org</a></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 7, 2016 at 9:30 AM, Nicholas Sauter <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:nksauter@lbl.gov" target="_blank">nksauter@lbl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">David,<div><br></div><div>I notice that the Pango version, 1.16.1, was released in 2007, so perhaps it is no surprise that the latest Ubuntu does not support it.  Maybe this calls for stepping forward the Pango version until you find one that works. I see that the latest stable release is 1.39.  </div><div><br></div><div>This would be valuable information for us..Billy Poon in the Phenix group is supporting the Phenix GUI, so it might be advisable for him to update the Pango version in the base installer.</div><div><br></div><div>Nick</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div><div dir="ltr"><div>Nicholas K. Sauter, Ph. D.<br>Computer Staff Scientist, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging Division<div>Lawrence Berkeley National Laboratory<br>1 Cyclotron Rd., Bldg. 33R0345<br>Berkeley, CA 94720<br><a href="tel:%28510%29%20486-5713" value="+15104865713" target="_blank">(510) 486-5713</a><br></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote"><div><div class="h5">On Thu, Jan 7, 2016 at 8:54 AM, David Waterman <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dgwaterman@gmail.com" target="_blank">dgwaterman@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br></div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5"><div dir="ltr">Hi again<div><br></div><div>Another data point: I just tried this on a different Ubuntu machine, this time running 14.04. In this case pango installed just fine. In fact all other packages installed too and the machine is now compiling cctbx.</div><div><br></div><div>I might have enough for comparison between the potentially working 14.04 and failed 15.04 builds to figure out what is wrong in the second case.</div><div><br></div><div>Cheers</div></div><div class="gmail_extra"><span><font color="#888888"><br clear="all"><div><div>-- David<br></div></div></font></span><div><div>
<br><div class="gmail_quote">On 7 January 2016 at 09:56, David Waterman <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:dgwaterman@gmail.com" target="_blank">dgwaterman@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi folks<div><br></div><div>I recently tried building cctbx+dials on Ubuntu 15.04 following the instructions here: <a href="http://dials.github.io/documentation/installation_developer.html" target="_blank">http://dials.github.io/documentation/installation_developer.html</a></div><div><br></div><div>This failed during installation of pango-1.16.1. Looking at pango_install_log, I see the command that failed was as follows:</div><div><br></div><div><div>gcc -DHAVE_CONFIG_H -I. -I. -I../.. -DSYSCONFDIR=\&quot;/home/fcx32934/sw/dials_bootstrap_test/base/etc\&quot; -DLIBDIR=\&quot;/home/fcx32934/sw/dials_bootstrap_test/base/lib\&quot; -DG_DISABLE_CAST_CHECKS -I../.. -DG_DISABLE_DEPRECATED -I/home/fcx32934/sw/dials_bootstrap_test/base/include -I/home/fcx32934/sw/dials_bootstrap_test/base/include/freetype2 -g -O2 -Wall -MT fribidi.lo -MD -MP -MF .deps/fribidi.Tpo -c fribidi.c  -fPIC -DPIC -o .libs/fribidi.o</div><div>In file included from fribidi.h:31:0,</div><div>                 from fribidi.c:28:</div><div>fribidi_config.h:1:18: fatal error: glib.h: No such file or directory</div><div><br></div><div>The file glib.h appears to be in base/include/glib-2.0/, however this directory was not explicitly included in the command above, only its parent. This suggests a configuration failure in pango to me. Taking a look at base_tmp/pango-1.16.1/config.log, I see what look like the relevant lines:</div><div><br></div><div><div>configure:22227: checking for GLIB</div><div>configure:22235: $PKG_CONFIG --exists --print-errors &quot;$GLIB_MODULES&quot;</div><div>configure:22238: $? = 0</div><div>configure:22253: $PKG_CONFIG --exists --print-errors &quot;$GLIB_MODULES&quot;</div><div>configure:22256: $? = 0</div><div>configure:22304: result: yes</div></div><div><br></div><div>but this doesn&#39;t tell me very much. Does anyone have any suggestions as to how I might proceed?</div><div><br></div><div>Many thanks</div><span><font color="#888888"><div><br></div><div><div>-- David<br></div></div>
</font></span></div></div>
</blockquote></div><br></div></div></div>
<br></div></div>_______________________________________________<br>
cctbxbb mailing list<br>
<a href="mailto:cctbxbb@phenix-online.org" target="_blank">cctbxbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>
cctbxbb mailing list<br>
<a href="mailto:cctbxbb@phenix-online.org">cctbxbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>