<div dir="ltr">Hi Graeme,<div><br></div><div><div>Mike Wall and I worked through the process back at the DIALS workshop in February.</div><div><br></div><div>The steps for compiling with the Intel compilers are,</div><div><br></div><div>1) Copy the base and modules directories (base came from the CentOS 6 build of cctbx)</div><div>2) Create the build directory</div><div>3) In the build directory, run <font face="monospace, monospace">python ../modules/cctbx_project/libtbx/configure.py dials xfel prime xfel_regression --compiler=&quot;icc&quot;</font></div><div>4) Run <font face="monospace, monospace">make</font> twice to completely compile everything.</div><div>5) Source setpaths.sh (or setpaths.csh) to set up the cctbx environment</div></div><div><br></div><div>The base dependencies are not compiled with the Intel compilers. There may be additional quirks with each dependency when using the Intel compilers.</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div>--</div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Billy K. Poon</span><br></div></div><div>Research Scientist, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging</div><div>Lawrence Berkeley National Laboratory</div><div>1 Cyclotron Road, M/S 33R0345</div><div>Berkeley, CA 94720</div><div>Tel: (510) 486-5709</div><div>Fax: (510) 486-5909</div><div>Web: <a href="https://phenix-online.org" target="_blank">https://phenix-online.org</a></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Thu, Jun 29, 2017 at 7:55 AM,  <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Graeme.Winter@diamond.ac.uk" target="_blank">Graeme.Winter@diamond.ac.uk</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-GB" link="blue" vlink="purple">
<div class="m_3722417150202634938WordSection1">
<p class="MsoNormal">Greetings all,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Do we have a recipe for compiling cctbx etc with icc?<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">To pick a random example, this version:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">icc (ICC) 17.0.4 20170411<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Copyright (C) 1985-2017 Intel Corporation.  All rights reserved.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Thanks Graeme<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><u></u><u></u></font></span></p><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
</font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">

<p align="justify"> </p>
<p align="justify">-- </p>
<p align="justify">This e-mail and any attachments may contain confidential, copyright and or privileged material, and are for the use of the intended addressee only. If you are not the intended addressee or an authorised recipient of the addressee please notify us of receipt by returning the e-mail and do not use, copy, retain, distribute or disclose the information in or attached to the e-mail.<br>Any opinions expressed within this e-mail are those of the individual and not necessarily of Diamond Light Source Ltd. <br>Diamond Light Source Ltd. cannot guarantee that this e-mail or any attachments are free from viruses and we cannot accept liability for any damage which you may sustain as a result of software viruses which may be transmitted in or with the message.<br>Diamond Light Source Limited (company no. 4375679). Registered in England and Wales with its registered office at Diamond House, Harwell Science and Innovation Campus, Didcot, Oxfordshire, OX11 0DE, United Kingdom<br> </p></font></span></div>


<br>______________________________<wbr>_________________<br>
cctbxbb mailing list<br>
<a href="mailto:cctbxbb@phenix-online.org">cctbxbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/cctbxbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/<wbr>mailman/listinfo/cctbxbb</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>