<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

<head>

  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">

  <title></title>

</head>

<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">

<br>

<blockquote cite="midPine.GSO.4.58.0605090157080.2179@sun" type="cite">

  <blockquote type="cite">

    <pre wrap="">

TEXTAL expects map in X-PLOR format but what kind of map?

One can make a number of different maps in CCP4 (simple, mFo-nFc, etc.). Which

type make TEXTAL happy?

    </pre>

  </blockquote>

  <pre wrap=""><!---->

Textal can deal with simple maps, back-transformed (Fc), and 2Fo-Fc maps.

One can also make such maps with phenix.refine, textal.makemap, or various

map-making tasks in the phenix GUI

  </pre>

</blockquote>

<br>

Just to mention: if you run the command <br>

% phenix.refine data.mtz model.pdb <br>

by default it will perform some model refinement (3 macro-cycles) and

will write out two maps mFo-DFc and 2mFo-DFc in XPLOR format.<br>

<br>

If you don't want any refinement to be performed, just type:<br>

% phenix.refine data.mtz model.pdb main.number_of_macro_cycles=1

main.refine_site=false main.refine_adp_individual=false<br>

this will do the anisotropic scaling, bulk solvent modeling,

calculation of m and D, and finally writing out two maps mFo-DFc and

2mFo-DFc.<br>

<br>

For more info and options look phenix.refine documentation at

<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.phenix-online.org/download/cci_apps/">http://www.phenix-online.org/download/cci_apps/</a><br>

<br>

Thanks for your questions,<br>

Pavel.<br>

<br>

<br>

</body>

</html>