Hi all and Pavel !!<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I asked this question more of academic interest than for any particular purpose. Thanks a lot.<br><br>regards<br>John<br><br><div><span class="gmail_quote">On 8/1/07, <b class="gmail_sendername">
Paul D. Adams</b> &lt;<a href="mailto:PDAdams@lbl.gov">PDAdams@lbl.gov</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Hi John,<br><br>&nbsp;&nbsp; no. This was done many years ago in XPLOR, but programs such as<br>phenix.refine, CNS and refmac do not use charges. Their inclusion<br>tends to generate problems (incorrectly placed residues being<br>strongly attracted to one another). In the future we hope to
<br>investigate methods to use charges towards the end of refinement.<br><br>&nbsp;&nbsp; Cheers<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Paul<br><br>On Aug 1, 2007, at 10:11 AM, john kryst wrote:<br><br>&gt; Hi all !!<br>&gt;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Please bare with me.. one general very basic question.
<br>&gt; Do we use electrostatic charges in x-ray refinement.<br>&gt;<br>&gt; regards<br>&gt; John<br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; phenixbb mailing list<br>&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">
phenixbb@phenix-online.org</a><br>&gt; <a href="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br><br>--<br>Paul Adams<br>Senior Staff Scientist, Physical Biosciences Division
<br>Head, Berkeley Center for Structural Biology<br>Deputy Principal Investigator, Berkeley Structural Genomics Center<br><br>Building 64, Room 248<br>Tel: 510-486-4225, Fax: 510-486-5909<br><a href="http://cci.lbl.gov/">
http://cci.lbl.gov/</a><br><br>Lawrence Berkeley Laboratory<br>1 Cyclotron Road<br>BLDG 64R0121<br>Berkeley, CA 94720, USA.<br>--<br><br><br>_______________________________________________<br>phenixbb mailing list<br><a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">
phenixbb@phenix-online.org</a><br><a href="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br></blockquote></div><br>