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<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7652.24">

<TITLE>RE: [phenixbb] conversion from h3 to r3 with phenix apps</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<!-- Converted from text/plain format -->


<P><FONT SIZE=2>I'm actually not sure that it's not orthorhombic. I know looking at the cell lengths and angles makes it very inviting to the cubic cell and i have been working with that as a possibility. i do have a real good suspicion that I have a pseudo-cubic cell. I can do molecular replacement in the cubic space group but am missing some density that I think should be there. I wanted to do molecular replacement in the rhombohedral setting and ultimately the lower symmetry space group too and see if I pick that density up. This is why I wanted to know how to convert the h3 to r3 setting. the h3 cell is a nightmare for my computer!<BR>

<BR>

as a side note not all of the crystals, process in the primitive lattice, but all process as rhombohedral. That probably means that I have a two different types of crystals more than anything else, etc etc etc. cross-xtal averaging is another reason to i wanted to figure out the setting difference.<BR>

<BR>

I have previously run one of my datasets processed in p1 thru Xtriage, it said:<BR>

<BR>

Exploring higher metric symmetry<BR>

<BR>

The point group of data as dictated by the space group is P 1<BR>

&nbsp; the point group in the niggli setting is P 1<BR>

The point group of the lattice is P 4 3 2<BR>

A summary of R values for various possible point groups follow.<BR>

<BR>

------------------------------------------------------------------------------------------------<BR>

| Point group&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | mean R_used | max R_used | mean R_unused | min R_unused | choice |<BR>

------------------------------------------------------------------------------------------------<BR>

| P 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | None&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | None&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.362&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | &lt;---&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 2 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.134&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.169&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.152&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.488&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.377&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.164&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 1 2 1 (z,x+y,-x+y)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.489&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.489&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.337&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4 2 2 (c,a,b)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.266&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.481&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.481&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 1 1 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.221&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 2 1 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.107&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.107&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.290&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 2 :R&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.481&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.483&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.109&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 1 2 1 (x+y,-x+y,z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.269&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 2 2 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.109&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.481&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 2 2 2 (x-y,x+y,z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.190&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.339&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4 (c,a,b)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.454&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.476&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.272&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 1 2 1 (x+y,z,x-y)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.483&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.483&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.351&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 1 2 1 (-x+y,z,x+y)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.486&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.486&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.351&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 1 2 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.343&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 2 :h (x+z,y-z,-x+y+z) | 0.488&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.109&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4 2 2 (b,c,a)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.181&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.486&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.480&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 :h (x+z,y-z,-x+y+z)&nbsp;&nbsp; | 0.148&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.148&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.256&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 2 2 2 (z,x-y,x+y)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.426&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.489&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.309&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 2 :h (-x+y+z,x+z,y-z) | 0.484&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.489&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.109&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 2 2 2 (-x+y,z,x+y)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.386&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.486&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.327&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4 2 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.243&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.386&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.169&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 :h (-x+y+z,x+z,y-z)&nbsp;&nbsp; | 0.153&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.153&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.256&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 :h (y-z,-x+y+z,x+z)&nbsp;&nbsp; | 0.164&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.164&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.256&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4 3 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.362&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | None&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | None&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 1 2 1 (x-y,x+y,z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.478&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.269&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 2 :h (y-z,-x+y+z,x+z) | 0.486&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.492&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.109&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| R 3 :R&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.169&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.169&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.256&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| P 4 (b,c,a)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.419&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.475&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.290&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.110&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

| C 1 2 1 (z,x-y,x+y)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.481&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.481&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.337&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.103&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<BR>

------------------------------------------------------------------------------------------------<BR>

<BR>

R_used: mean and maximum R value for symmetry operators *used* in this point group<BR>

R_unused: mean and minimum R value for symmetry operators *not used* in this point group<BR>

&nbsp;The likely point group of the data is:&nbsp; P 1<BR>

<BR>

Possible space groups in this point groups are:<BR>

&nbsp;&nbsp; Unit cell: (375.144, 375.711, 377.723, 90.002, 90.034, 90.094)<BR>

&nbsp;&nbsp; Space group: P 1 (No. 1)<BR>

<BR>

what does this say to you?<BR>

<BR>

Thanks in advance-<BR>

Todd<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

-----Original Message-----<BR>

From: phenixbb-bounces@phenix-online.org on behalf of Peter Zwart<BR>

Sent: Fri 8/10/2007 4:35 PM<BR>

To: PHENIX user mailing list<BR>

Subject: Re: [phenixbb] conversion from h3 to r3 with phenix apps<BR>

<BR>

Hi Todd,<BR>

<BR>

Are you sure this is not cubic? You could run xtriage and find out<BR>

relatively easely.<BR>

<BR>

I suggest you give phenix.xmanip a try for reindexing or try to use the<BR>

following one-liner:<BR>

<BR>

iotbx.reflection_file_converter data.sca<BR>

--change-of-basis=to_niggli_cell --sca=niggli.sca<BR>

<BR>

Cheers<BR>

<BR>

Peter<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

Green, Todd wrote:<BR>

&gt;<BR>

&gt; Hello all,<BR>

&gt;<BR>

&gt; I have what i believe to be a rhombohedral crystal that has an<BR>

&gt; insanely large cell with the hexagonal setting:<BR>

&gt;<BR>

&gt; 533.026&nbsp;&nbsp; 533.026&nbsp;&nbsp; 652.887&nbsp;&nbsp;&nbsp; 90.000&nbsp;&nbsp;&nbsp; 90.000&nbsp;&nbsp; 120.000<BR>

&gt;<BR>

&gt; and a modestly large cell comparatively with the rhombohedral setting:<BR>

&gt;<BR>

&gt; 377 377 377 90 90 90<BR>

&gt;<BR>

&gt; I should be able to easily reindex to the smaller cell in scalepack<BR>

&gt; but for some reason i'm not getting it to work correctly. Rather than<BR>

&gt; struggle further on a friday afternoon, i figured that i'd give a<BR>

&gt; phenix app a try. i assume xtriage can do this, can someone point me<BR>

&gt; in the correct direction?<BR>

&gt;<BR>

&gt; thanks in advance-<BR>

&gt; Todd<BR>

&gt;<BR>

&gt; ------------------------------------------------------------------------<BR>

&gt;<BR>

&gt; _______________________________________________<BR>

&gt; phenixbb mailing list<BR>

&gt; phenixbb@phenix-online.org<BR>

&gt; <A HREF="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</A><BR>

&gt;&nbsp;&nbsp;<BR>

<BR>

<BR>

This email was scanned with Mcafee's Anti-Virus appliance, but this<BR>

is no guarantee that no virus exists. You are asked to make sure you<BR>

have virus protection and that it is up to date.<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

</FONT>

</P>


</BODY>

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