<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hi Francis,<br>
<br>
by default both F+ and F- are used in phenix.refine. However, you can
request that the average values, Fobs_ave = (F+ + F-)/2 are used
instead ("xray_data.force_anomalous_flag_to_be_equal_to=False" keyword).<br>
<br>
Peter may have more details on how this is handled in twin-refinement.<br>
<br>
Pavel.<br>
<br>
<br>
On 10/20/2008 7:45 AM, Francis E Reyes wrote:
<blockquote cite="mid:3B36B436-DCDA-43FA-9E8B-1987E4C91DF5@colorado.edu"
 type="cite">All
  <div><br>
  </div>
  <div>How does phenix.refine handle the twin refinement target when
refining against F+/F-? &nbsp;I'm specifically asking for the proper
assignment of F+/F- for twin related reflections (<font
 class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial">e.g.&nbsp;</font><span
 class="Apple-style-span"
 style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: arial;">10.1107/S0907444902021704).
&nbsp;My data is currently in P41 with friedel pairs as output by scala.&nbsp;</span></div>
  <div><font class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial"><br>
  </font></div>
  <div><font class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial"><br>
  </font></div>
  <div><font class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial">Thanks</font></div>
  <div><font class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial"><br>
  </font></div>
  <div><font class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial">FR</font></div>
  <div><font class="Apple-style-span" color="#333333" face="arial"><br>
  </font></div>
  <div>
  <div> <span class="Apple-style-span"
 style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;">
  <div style="">
  <div>---------------------------------------------<br>
Francis Reyes M.Sc.<br>
215 UCB<br>
University of Colorado at Boulder<br>
  <br>
gpg --keyserver pgp.mit.edu --recv-keys 67BA8D5D<br>
  <br>
8AE2 F2F4 90F7 9640 28BC &nbsp;686F 78FD 6669 67BA 8D5D</div>
  </div>
  </span> </div>
  <br>
  </div>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
  </pre>
</blockquote>
</body>
</html>