<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hi Amit,<br>
<br>
1) start phenix.refine GUI;<br>
2) load in your model and data;<br>
3) Under "Refinement settings" click (once or twice, figure out) on
"Individual sites". This will pop up the selection window "Selections
for individual site refinement". Type in atom selections for atoms that
you want to refine (or that you don't want to refine with leading
"not"). <br>
<br>
For atom selection examples see:<br>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.phenix-online.org/documentation/refinement.htm#anch82">http://www.phenix-online.org/documentation/refinement.htm#anch82</a><br>
<br>
Please let us know if you have any questions.<br>
<br>
Pavel.<br>
<br>
<br>
On 6/2/09 4:29 AM, AMIT wrote:
<blockquote
 cite="mid:b7a7f5760906020429n502fc69el128149e7bf044127@mail.gmail.com"
 type="cite">Hi All<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Is it possible to fix only the coordinates(xyz's) of residues
or individual atoms in phenix.refine_gui while refining it for rest of
the atoms? <br>
  <br>
Any suggestions will be helpful.<br>
  <br>
Thanks in advance <br>
Amit. <br clear="all">
  <br>
-- <br>
AMIT DAS, <br>
PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY SECTION, <br>
SOLID STATE PHYSICS DIVISION, BARC, TROMBAY, <br>
MUMBAI-400085.<br>
INDIA.<br>
Alt <a moz-do-not-send="true"
 href="mailto:E-mail%3Aamitdas@barc.gov.in">E-mail:amitdas@barc.gov.in</a><br>
PHONE:+91-22-25594688/4063<br>
FAX:+91-22-25505151<br>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
  </pre>
</blockquote>
</body>
</html>