Those commands represent the resolution of the image you&#39;re generating- you can do &quot;ray 1600,1200&quot;, for example, to get a 1600 X 1200 pixel image.<br><br>-Sam<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Sep 1, 2009 at 2:40 PM, Pavel Afonine <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:PAfonine@lbl.gov">PAfonine@lbl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi Raja,<br>
<br>
here is what I usually do to get a paper-quality picture out of PyMol:<br>
<br>
once I have model and maps displayed, I issues these commands:<br>
<br>
ray 500,500<br>
png file_name<br>
<br>
You need to play with the above numbers to get the picture you like, and<br>
it will be saved under file name file_name.png.<br>
Since I use Pymol one a year or so, I can&#39;t remember what the above<br>
&quot;magic&quot; numbers/commands mean.<br>
<br>
Pavel.<br>
<br>
<br>
On 9/1/09 11:16 AM, Raja Dey wrote:<br>
&gt; Dear Friends,<br>
&gt;                      Sorry, for the of topic question. Does anyone can tell how to improve the quality of a picture showing the electron density map of dna in a complex using PYMOL. I created the figure, but not happy with the quality as it is now. Might be there is a way to improve which I don&#39;t know. I want the lines in the mesh to be more sharp and fine. Any suggested program to prepare a publication quality figure to show the ED map would be of great help.<br>

&gt; Thanking you in advance...<br>
&gt; Raja<br>
&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
&gt;<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</blockquote></div><br>