<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Ligandfit problems with ligand geometry</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:12.0px'>I just tried ligandfit for the first time and it did not maintain proper geometry of the ligand. There were problems with both bond lengths and planarity. Is there a way to specify a .cif file? The ligand pdb was generated with PROGRD2, and I have had good success refining a structure that contains a very close analog with phenix.refine. <BR>
<BR>
Kendall Nettles</SPAN></FONT>
</BODY>
</HTML>