
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

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  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">

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<br>

<blockquote cite="mid:C728882E.6F93%25knettles@scripps.edu" type="cite"><font

 face="Geneva, Verdana, Helvetica, Arial"><span style="font-size: 11pt;">You

might also consider excluding the regions with poor geometry from the

NCS groups, to see if they are in fact different. You are also forcing

NCS regardless of the RMS distance. I would refine a few rounds without

NCS and with the default refinement parameters, and then then turn the

NCS back on. Look in the .geo file for excessive distances, and examine

these regions in Coot using the NCS ghosts and maps to decide if they

should be excluded from the NCS groups. <br>

  </span></font></blockquote>

<br>

Thanks Kendall, it is very good point. We should probably do something

like this to automatically adjust NCS restraints during refinement.<br>

<br>

<font face="Geneva, Verdana, Helvetica, Arial">Pavel.<br>

<br>

</font>

</body>

</html>