Hi, All,<br><br>Sorry for this stupid question. When I tried to use phenix to validate the structure, it generate geometry outliers, model validation, real-space correlations and a phenix_map_coeffs.mtz file which I assume could be open in coot. How should I use this generated mtz file? When I open in coot, it tellls me core dump. I&#39;m wondering if phenix will automatically do the corrections or should I look one by one in the log file and modify? It also generate a test_reduced.pdb, should I use this reduced pdb ( H added) for next round of refinement? Thanks.<br>
<br>Is the format from phenix.refine ready for deposit?<br>