<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Hi, Tom and Nat<br><br>After reading your replies, I found out that I misunderstand some precesses. Your answers make it much clear.<br>Thanks!<br><br>PC <br><br>&gt; From: NEchols@lbl.gov<br>&gt; Date: Sat, 12 Dec 2009 15:58:36 +0000<br>&gt; To: phenixbb@phenix-online.org<br>&gt; Subject: Re: [phenixbb] How to extend R-free set to higher resolution by new        phenix-1.5.2<br>&gt; <br>&gt; On Dec 12, 2009, at 3:36 PM, Thomas C. Terwilliger wrote:<br>&gt; &gt; I think reflection_file_editor will only copy arrays (or columns) of data,<br>&gt; &gt; and not merge several columns of data into one.<br>&gt; <br>&gt; Correct.<br>&gt; <br>&gt; Assuming you just want to combine the new data and old test set, based on what Tom said, you will need the old data file with R-free flags, and either the Scalepack file (if you want to keep your intensities, and/or you have anomalous data) or exptl_fobs_phases_freeR_flags.mtz (if you're happy with non-anomalous amplitudes).  The output arrays should be the R-free and the new amplitudes or intensities*, which will probably be labeled 'F,SIGF' or 'i_obs,sigma' or something similar.  Everything else should work automatically - the extend R-free option is on by default.  If the program gives you an error, please email me (not the list!) the files and I'll see if I can figure out what is breaking.  It might be worth trying the latest nightly build too (currently dev-249), because there have been many improvements and new features in that program.<br>&gt; <br>&gt; -Nat<br>&gt; <br>&gt; (* Plus Hendrickson-Lattman coefficients from experimental phasing, if you have them.)<br>&gt; <br>&gt; --------------------<br>&gt; Nathaniel Echols<br>&gt; Lawrence Berkeley Lab<br>&gt; 510-486-5136<br>&gt; NEchols@lbl.gov<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; phenixbb mailing list<br>&gt; phenixbb@phenix-online.org<br>&gt; http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb<br>                                               <br /><hr />Windows Live Hotmail:  <a href='http://www.microsoft.com/middleeast/windows/windowslive/see-it-in-action/social-network-basics.aspx?ocid=PID23461::T:WLMTAGL:ON:WL:en-xm:SI_SB_4:092009' target='_new'>Your friends can get your Facebook updates, right from HotmailŪ.</a></body>
</html>