<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:12pt">Hi<br>&gt;&gt;. Does Coot have toolbar buttons labeled "Hydrogens on" and "Connected to Phenix" (or something very similar)?<br>No<br><br>2. What is the output of "coot --version"?<br><div style="font-family: arial,helvetica,sans-serif; font-size: 12pt;">$coot --version<br>bin/coot-real --version<br>0.6 (revision 2540)&nbsp; [with guile 1.8.7 embedded] [with python 2.6.0 embedded]<br><br>Thanks<br><br><div style="font-family: arial,helvetica,sans-serif; font-size: 13px;"><font size="2" face="Tahoma"><hr size="1"><b><span style="font-weight: bold;"><br>From:</span></b> Nathaniel Echols &lt;NEchols@lbl.gov&gt;<br><b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> PHENIX user mailing list &lt;phenixbb@phenix-online.org&gt;<br><b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Tue, January 5, 2010 4:39:38
 PM<br><b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> Re: [phenixbb] coot - display map<br></font><br>
On Jan 5, 2010, at 2:34 PM, r n wrote:<br>&gt; I am using Phenix GUI, after refinement , tried to load the coot interface in Phenix, it opens up<br>&gt; the coot, but did not load the map or model file. I am using coot0.6 version, Is there any place in <br>&gt; phenix enviroment that I could mention the path for coot?<br><br>It is very likely that the build of Coot you are using is defective or incomplete (e.g. Python not included).&nbsp; Two questions:<br><br><br>1. Does Coot have toolbar buttons labeled "Hydrogens on" and "Connected to Phenix" (or something very similar)?<br><br>2. What is the output of "coot --version"?<br><br>thanks,<br>Nat<br><br>-------------------<br>Nathaniel Echols<br>Lawrence Berkeley Lab<br>510-486-5136<br><a ymailto="mailto:NEchols@lbl.gov" href="mailto:NEchols@lbl.gov">NEchols@lbl.gov</a><br><br><br><br>_______________________________________________<br>phenixbb mailing list<br><a ymailto="mailto:phenixbb@phenix-online.org"
 href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br><span><a target="_blank" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a></span><br></div></div>
<!-- cg2.c1.mail.mud.yahoo.com compressed/chunked Mon Jan  4 15:15:54 PST 2010 -->
</div><br>

      </body></html>