Hi Peter,<br><br>thanks.  <br><br>here the Rvalues after rigid body refmac:<br><br>                  R          Rfr    <br>P6122      0.371    0.377<br>P61          0.361    0.369<br>P31          0.337    0.338  twin<br>P3121      0.376    0.378  twin <br>

P321        no solution<br><br><br>Now, RvsR stats in P3121 are as following: <br><br>R_abs_twin observed data   : 0.155<br>R_abs_twin calculated data  : 0.372<br>
<br>&quot;Twins with RPS&quot; (Lebedev, Vagin, Murshudov 2006, Acta Cryst. D62,83-95).<br><br>But the refinement doesnt look better than P31.<br><br>Thanks again. Cheers,<br><br>Gabriela<br> <br><br><div class="gmail_quote">


On Sat, Jan 2, 2010 at 5:45 PM, Peter Zwart <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:phzwart@gmail.com" target="_blank">phzwart@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi Gabriela,<br>
<br>
Can you give us some more info? What are the excat r-values in all space groups?<br>
<br>
How does the refinement in p321 or p312 look?<br>
<br>
Cheers,<br>
<br>
Peter<br>
<br>
<br>
2010/1/2 Gabriela Guédez &lt;<a href="mailto:gguedez@gmail.com" target="_blank">gguedez@gmail.com</a>&gt;:<br>
<div><div></div><div>&gt; Hi Phenixbb,<br>
&gt;<br>
&gt; I have a data that indexes in P6122, also P61 and P31. Data analysis in<br>
&gt; phenix.xtriage says no twinning is suspected according to the L-test.<br>
&gt;<br>
&gt; However, after MR and twin RB refinement, the model improves from P6122 or<br>
&gt; P61 to P31 5% Rfacs and 0.5 the FOM.<br>
&gt;<br>
&gt; I thought the data might have RPS and twinning not detected with the L-test.<br>
&gt; So, i ran xtriage to compute the RvsR statistics using the obs_and_calc.mtz<br>
&gt; file and the results were:<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; in P61<br>
&gt; R_abs_twin observed data   : 0.112<br>
&gt; R_abs_twin calculated data : 0.047<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; in P31<br>
&gt; R_abs_twin observed data   : 0.117<br>
&gt; R_abs_twin calculated data : 0.139<br>
&gt;<br>
&gt; &quot;misespecified crystal symmetry&quot;, according to Lebedev, Vagin, Murshudov et<br>
&gt; al 2006, Acta Cryst. D62,83-95.<br>
&gt;<br>
&gt; I would like to know a test that tells me the right symmetry.<br>
&gt;<br>
&gt; I appreciate your help. Thanks,<br>
&gt;<br>
&gt; Gabriela<br>
&gt;<br>
</div></div>&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
-----------------------------------------------------------------<br>
P.H. Zwart<br>
Beamline Scientist<br>
Berkeley Center for Structural Biology<br>
Lawrence Berkeley National Laboratories<br>
1 Cyclotron Road, Berkeley, CA-94703, USA<br>
Cell: 510 289 9246<br>
BCSB:     <a href="http://bcsb.als.lbl.gov" target="_blank">http://bcsb.als.lbl.gov</a><br>
PHENIX: <a href="http://www.phenix-online.org" target="_blank">http://www.phenix-online.org</a><br>
CCTBX:  <a href="http://cctbx.sf.net" target="_blank">http://cctbx.sf.net</a><br>
-----------------------------------------------------------------<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>----------------------------------------------------------------------<br>Gabriela Guédez R.<br><a href="mailto:gabriela.guedez@bzh.uni-heidelberg.de" target="_blank">gabriela.guedez@bzh.uni-heidelberg.de</a><br>