<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hello,<br>
<br>
1) try playing with the target weight (refinement of coordinates). For
this, try an array of values for wxc_scale and see which one works best;<br>
<br>
2) manually fix the outliers and do "1)".<br>
<br>
Pavel.<br>
<br>
<br>
On 1/14/10 3:51 AM, <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:v_kukshal@cdri.res.in">v_kukshal@cdri.res.in</a> wrote:
<blockquote cite="mid:21222.172.16.0.72.1263469878.squirrel@172.16.1.7"
 type="cite">i am solving one of my structure&nbsp; with resolution 3.0 .<br>
i used phenix auto build for building . R factor and Rfree is now
20.4&nbsp;&nbsp; 24.9 but 69 residue out of 800 residue are outlier in
ramchandran plot . further refinment increses the r factor how should i
can step further <br>
thanx &nbsp; <br>
  <br>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
  </pre>
</blockquote>
</body>
</html>