Dear All,<div><br></div><div>I am using the latest Phenix version (356) with the GUI and I would like to see the effect of optimization of the mask parameters.</div><div>How can I do this with the GUI in the latest version ( I am also using the secondary structure restraints)</div>
<div>in the manual I can see the command line</div><div>phenix.refine model.pdb data.mtz optimize_mask=true however I don&#39;t see such option in the GUI (I can&#39;t see it  listed  in the whole list of commands)<br clear="all">
<br></div><div>Thanks in advance</div><div><br>-- <br>Pascal F. Egea, PhD<br>Assistant Professor<br>UCLA, David Geffen School of Medicine<br>Department of Biological Chemistry<br>314 Biomedical Sciences Research Building <br>
office (310)-983-3515<br>lab          (310)-983-3516<br>email         <a href="mailto:pegea@mednet.ucla.edu">pegea@mednet.ucla.edu</a><br><br>
</div>