<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
  <title></title>
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hi Jason,<br>
<br>
sorry for the lack of documentation on this matter. <br>
<br>
I posted some information about real-space refinement on phenixbb
several times within last month. Here it is:<br>
<br>
<a class="moz-txt-link-freetext"
 href="http://cci.lbl.gov/%7Eafonine/rsr.pdf">http://cci.lbl.gov/~afonine/rsr.pdf</a>
<br>
<br>
but I agree this doesn't replace the proper documentation. <br>
<br>
Let me know if you have any questions.<br>
<br>
Pavel.<br>
<br>
<br>
On 4/16/10 12:52 PM, Jason C Porta wrote:
<blockquote
 cite="mid:OFCDF2E70C.AD76E54E-ON86257707.006D32D4-86257707.006D32DD@unmc.edu"
 type="cite"><font
 face="Default Sans Serif,Verdana,Arial,Helvetica,sans-serif" size="2">Hi
everyone, <br>
  <br>
I'm currently looking for some info on the "fix rotamer" option in
phenix.refine. I searched the online docs and board archives, but came
up empty. <br>
  <br>
Could someone please explain to me how the software carries out the
rotamer refinement? From the log file it looks like a map is calculated
for each rotamer followed by a real-space refinement? Am I thinking on
the right track? <br>
  <br>
Thanks in advance!<br>
Jason<br>
  </font></blockquote>
</body>
</html>