<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Jianghai,<div><br></div><div>You can do this in two ways for autosol and autobuild:</div><div><br></div><div>1. in your original runs, you can say clean_up=True (default is False):</div><div><br></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: verdana, helvetica, arial, sans-serif; font-size: 16px; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px; "><pre>      clean_up= <span style="color: rgb(204, 0, 0); ">False</span> <span style="color: blue; ">At the end of the entire run the TEMP directories will
                be removed if clean_up is True. The default is No, keep these
                directories. If you want to remove them after your run is
                finished use a command like "phenix.autobuild run=1
                clean_up=True"</span></pre><pre><span style="color: blue; "><br></span></pre><pre><font class="Apple-style-span" color="#0000FF"><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium; ">2. after you are done with a run you can remove any TEMP0 subdirectories in your runs, as all the key files have been written to the main directories (AutoSol_run_1_ etc).</div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium; "><font class="Apple-style-span" color="#0000FF" face="monospace" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 16px; white-space: pre; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><font class="Apple-style-span" color="#000000" face="Helvetica"><span class="Apple-style-span" style="white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium;"><br></span></font></span></font></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium; "><font class="Apple-style-span" color="#0000FF" face="monospace" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 16px; white-space: pre; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><font class="Apple-style-span" color="#000000" face="Helvetica"><span class="Apple-style-span" style="white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium;">All the best,</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium; "><font class="Apple-style-span" color="#0000FF" face="monospace" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 16px; white-space: pre; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><font class="Apple-style-span" color="#000000" face="Helvetica"><span class="Apple-style-span" style="white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium;">Tom T</span></font></span></font></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium; "><font class="Apple-style-span" color="#0000FF" face="monospace" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 16px; white-space: pre; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><font class="Apple-style-span" color="#000000" face="Helvetica"><span class="Apple-style-span" style="white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium;"><br></span></font></span></font></div><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium; "><font class="Apple-style-span" color="#0000FF" face="monospace" size="4"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 16px; white-space: pre; -webkit-border-horizontal-spacing: 2px; -webkit-border-vertical-spacing: 2px;"><font class="Apple-style-span" color="#000000" face="Helvetica"><span class="Apple-style-span" style="white-space: normal; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; font-size: medium;"><br></span></font></span></font></div></font></pre></span><div><div>On Aug 18, 2010, at 8:14 AM, Jianghai Zhu wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div>Hi,<br><br>I realize that after a phenix run, especially autobuild and autosol, there are a lot of temporary files. &nbsp;Is there a way to clean up the disk? &nbsp;Even the .geo file can be removed after some time, because it is huge and can be easily regenerated. &nbsp;<br><br>-- Jianghai<br><br><br><br><br>_______________________________________________<br>phenixbb mailing list<br><a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb<br></div></blockquote></div><br><div apple-content-edited="true"> <div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; font-size: 12px; "><div><div><div><div><div><br>Thomas C. Terwilliger<br>Mail Stop M888<br>Los Alamos National Laboratory<br>Los Alamos, NM 87545<br><br>Tel:&nbsp; 505-667-0072&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; email: <a href="mailto:terwilliger@LANL.gov">terwilliger@LANL.gov</a><br>Fax: 505-665-3024&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; SOLVE web site:&nbsp;<a href="http://solve.lanl.gov">http://solve.lanl.gov</a><br>PHENIX web site: http:<a href="http://www.phenix-online.org">www.phenix-online.org</a><br>ISFI Integrated Center for Structure and Function Innovation web&nbsp;site:&nbsp;<a href="http://techcenter.mbi.ucla.edu">http://techcenter.mbi.ucla.edu</a><br>TB Structural Genomics Consortium web site:&nbsp;<a href="http://www.doe-mbi.ucla.edu/TB">http://www.doe-mbi.ucla.edu/TB</a></div><div>CBSS Center for Bio-Security Science web site: <a href="http://www.lanl.gov/cbss">http://www.lanl.gov/cbss</a><br><br></div></div></div></div><br></div></div><br class="Apple-interchange-newline"> </div><br></div></body></html>