<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi Joel,<br>
    <br>
    it used to be the known issue for some rare cases until I fixed it a
    few months ago. So:<br>
    <br>
    1) could you please try the latest PHENIX from nightly builds and
    see if you still have this problem:<br>
    <br>
    <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.phenix-online.org/download/nightly_builds.cgi">http://www.phenix-online.org/download/nightly_builds.cgi</a><br>
    <br>
    2) if you still have this problem even using the latest PHENIX, then
    please send me the data and model (and, optionally the command you
    used that lead to these maps) and I will investigate.<br>
    <br>
    Pavel.<br>
    <br>
    <br>
    On 10/20/10 11:58 AM, Joel Weadge wrote:
    <blockquote cite="mid:SNT110-W10DC61DCC6BD0FCF3C73F6D65C0@phx.gbl"
      type="cite">
      <style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Tahoma
}
--></style>
      <div><br>
      </div>
      <div><span class="Apple-style-span" style="font-family:
          Tahoma,Verdana,Arial,sans-serif; color: rgb(42, 42, 42);">
          <div style="line-height: 17px;">Hi all,</div>
          <div style="line-height: 17px;"><br style="line-height: 17px;">
          </div>
          <div style="line-height: 17px;">I have just finished doing
            molecular replacement and an initial round of refinement
            (with simulated annealing) on a number of different
            datasets. They have all be straightforward since most of
            them are either point mutants and/or co-crystal structures.
            However, two of the structures are giving me some trouble.
            The data appears to be of good quality and resolution (2.25
            and 2.55&Aring;). The MR proceeds as normal with good scores and
            then in the subsequent round of refinement the maps (2Fo-Fc
            and Fo-Fc) look strange. The density is stretched or
            flattened in one direction. Can anyone help me with what I
            may be overlooking?</div>
          <div style="line-height: 17px;"><br style="line-height: 17px;">
          </div>
          <div style="line-height: 17px;">Thanks in advance</div>
          <div style="line-height: 17px;">JW<br>
          </div>
        </span></div>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>