<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi Chen,<br>
    <br>
    energy function:<br>
    <br>
    Grosse-Kunstleve RW, Afonine PV, Adams PD:<br>
    cctbx news: Geometry restraints and other new features<br>
    Newsletter of the IUCr Commission on Crystallographic Computing
    2004, 4, 19-36.<br>
    <br>
    Target values: <br>
    <br>
    CCP4 Monomer Library and phenix.elbow or phenix.ready_set<br>
    <br>
    Pavel.<br>
    <br>
    On 12/2/10 3:43 PM, <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:chene@umbi.umd.edu">chene@umbi.umd.edu</a> wrote:
    <blockquote cite="mid:f6f6359d365d.4cf7e8c7@umbi.umd.edu"
      type="cite"><font><font size="2">Dear authors of PHENIX,<br>
          I just want to know what force field is used by phenix.refine,<br>
          especially for simulated annealing, CHARMM, AMBER, or what
          else?<br>
          Thanks.<br>
          <br>
          Chen</font></font><br>
      <br>
      Chen Chen, PhD, Research Associate<br>
      Center for Advanced Research in Biotechnology (CARB),<br>
      University of Maryland Biotechnology Institute (UMBI),<br>
      9600 Gudelsky Drive, Rockville, MD 20850<br>
      240-314-6122 <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>