Dear Phenixers, <br>I have a low resolution twinned data, for which I disabled cross validation in refinement. The refinement worked and exported the refined coordinates. However, the phs files for maps are empty and there were such errors as below. It seems the free set is required for maps.<br>I wonder how to fix this problem?<br>Thanks<br>Chen<br><br>Traceback (most recent call last):<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/phenix/phenix/command_line/refine.py", line 11, in &lt;module&gt;<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; command_line.run(command_name="phenix.refine", args=sys.argv[1:])<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/phenix/phenix/refinement/command_line.py", line 103, in run<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; map_manger.write_files()<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/phenix/phenix/refinement/driver.py", line 1281, in write_files<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; fmodel = self.refine_object.fmodels.fmodel_xray(), params = mtz_mc)<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/cctbx_project/mmtbx/maps/__init__.py", line 290, in map_coefficients_from_fmodel<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; centrics_pre_scale = params.centrics_pre_scale)<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/cctbx_project/mmtbx/twinning/twin_f_model.py", line 1780, in map_coefficients<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; w2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = w2)<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/cctbx_project/mmtbx/twinning/twin_f_model.py", line 1695, in map_coefficients<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; sigmaa_object = self.sigmaa_object( detwinned_data=dt_f_obs,f_model_data=tmp_f_model, tmp_free=tmp_free,forced_update=True)<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/cctbx_project/mmtbx/twinning/twin_f_model.py", line 1504, in sigmaa_object<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; kernel_width_free_reflections=200,<br>&nbsp; File "/home/chene/phenix-1.6.4-486/cctbx_project/mmtbx/scaling/sigmaa_estimation.py", line 131, in __init__<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; raise RuntimeError("No free reflections.")<br>RuntimeError: No free reflections.<br><BR><BR>Chen Chen, PhD, Research Associate<br>Center for Advanced Research in Biotechnology (CARB),<br>University of Maryland Biotechnology Institute (UMBI),<br>9600 Gudelsky Drive, Rockville, MD 20850<br>240-314-6122 </BR></BR>