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<TITLE>Re: [phenixbb] Autobuild: problems with modified amino acids</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>Hi Tom, <BR>

Thanks for the quick reply. It would be nice to be able to use the modified amino acids in the future. We have a couple dozen structures of the same protein with different ligands, so it adds up to quite a bit of editing. <BR>

<BR>

I tried your suggestion and got this: <BR>

<BR>

Last login: Fri Jan 14 13:26:20 on ttys000<BR>

knettles$ &nbsp;source /usr/local/phenix-1.6.4-486/phenix_env.sh<BR>

knettles$ phenix.autobuild show_facts | grep semet<BR>

Sorry &nbsp;&nbsp;&nbsp;semet = False<BR>

: No current run to carry on with...cannot use carry_on<BR>

<BR>

<BR>

I didn&#8217;t input a parameters file, and there is no semet in the structure. The autobuild.eff file says:<BR>

<BR>

model_building {<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;build_type = *RESOLVE RESOLVE_AND_BUCCANEER<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;allow_negative_residues = False<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;highest_resno = &quot;697&quot;<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;semet = False<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;use_met_in_align = Auto True *False<BR>

<BR>

Any other ideas about where it could be coming from? <BR>

Best regards, <BR>

Kendall<BR>

<BR>

On 1/19/11 11:26 AM, &quot;Thomas C. Terwilliger&quot; &lt;<a href="terwilliger@lanl.gov">terwilliger@lanl.gov</a>&gt; wrote:<BR>

<BR>

</SPAN></FONT><BLOCKQUOTE><FONT FACE="Calibri, Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:11pt'>Hi Kendall,<BR>

<BR>

I can help with the first problem at least...<BR>

<BR>

Can you try this:<BR>

<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;phenix.autobuild show_facts | grep semet<BR>

<BR>

That should yield (if everything is normal):<BR>

<BR>

phenix.autobuild show_facts | grep semet<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;semet = False<BR>

default_semet 0<BR>

semet &nbsp;&quot;False&quot;<BR>

<BR>

If it says semet True ...then we need to figure out where the True is<BR>

coming from. &nbsp;Possibilities: (1) somewhere in your parameters file, (2)<BR>

any MSE in your input PDB file.<BR>

<BR>

To just override semet=True, you can just specify &quot;semet=False&quot; and that<BR>

may take care of the problem.<BR>

<BR>

I hope that helps for that problem!<BR>

<BR>

On the second problem: &nbsp;AutoBuild won't build models with modified<BR>

residues, but you should be able to pass your cif file to phenix.refine<BR>

through autobuild with<BR>

<BR>

&nbsp;&nbsp;refine_eff_file_list=my_refine_parameters.eff<BR>

<BR>

where this parameters file has the commands for phenix.refine that you<BR>

list below.<BR>

<BR>

In this particular case I don't think this is going to do exactly what you<BR>

want, however, as AutoBuild is going to remove the modified residues and<BR>

call them &quot;ligands&quot; and treat them separately from the rest of the model.<BR>

So refinement may not work quite optimally. &nbsp;Down the road I intend to<BR>

make AutoBuild take care of this sort of situation in a better way. For<BR>

now you might do best to run AutoBuild with a dummy unmodified residue,<BR>

then when you are all done, edit to put in your modified residue.<BR>

<BR>

All the best,<BR>

Tom T<BR>

<BR>

&gt;&gt; I'm running autobuild from a molecular replacement solution and having two<BR>

&gt;&gt; problems:<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt; &nbsp;1. &nbsp;methionines are converted to MSE<BR>

&gt;&gt; &nbsp;2. &nbsp;I'd like to include a .cif file for b-mercapto-ethanol adducted<BR>

&gt;&gt; cysteines: CME. The .cif file is one that works for phenix.refine (listed<BR>

&gt;&gt; below). I suspect I am not writing the .eff file correctly:<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt; refinement.pdb_interpretation.apply_cif_modification<BR>

&gt;&gt; {<BR>

&gt;&gt; &nbsp;&nbsp;data_mod = cme<BR>

&gt;&gt; &nbsp;&nbsp;residue_selection = chain A and resid 530<BR>

&gt;&gt; &nbsp;&nbsp;residue_selection = chain B and resid 381<BR>

&gt;&gt; }<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt; Thanks!<BR>

&gt;&gt; Kendall Nettles<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt; # electronic Ligand Builder and Optimisation Workbench (eLBOW)<BR>

&gt;&gt; # &nbsp;&nbsp;- a module of PHENIX version 1.6-289 (Mon Jan 21 12:43:00 2010)<BR>

&gt;&gt; # &nbsp;&nbsp;- file written: Sat May 22 10:41:08 2010<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; # &nbsp;&nbsp;Input file: /AutoBuild_run_1_/TEMP0/LIGANDS.pdb<BR>

&gt;&gt; # &nbsp;&nbsp;Residue: CME<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; data_comp_list<BR>

&gt;&gt; loop_<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.three_letter_code<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.name<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.group<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.number_atoms_all<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.number_atoms_nh<BR>

&gt;&gt; _chem_comp.desc_level<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CME 'Unknown &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;' ligand 21 10 .<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; data_comp_CME<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; loop_<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_atom.comp_id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_atom.atom_id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_atom.type_symbol<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_atom.type_energy<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_atom.partial_charge<BR>

&gt;&gt;<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;NH2 &nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;C1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;CH1 &nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;CH2 &nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;S &nbsp;&nbsp;S2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;S &nbsp;&nbsp;S2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;CH2 &nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;CH2 &nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;OH1 &nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HNH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HNH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH1 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HCH2 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HH1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;HOH1 &nbsp;.<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; loop_<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_bond.comp_id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_bond.atom_id_1<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_bond.atom_id_2<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_bond.type<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_bond.value_dist<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_bond.value_dist_esd<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.450 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;double &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.224 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.492 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.497 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.780 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;2.018 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.783 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.485 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;1.374 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.913 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.914 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.965 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.975 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.966 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.973 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.972 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.973 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.976 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.968 0.02<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HH1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;single &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0.880 0.02<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; loop_<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_angle.comp_id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_angle.atom_id_1<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_angle.atom_id_2<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_angle.atom_id_3<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_angle.value_angle<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_angle.value_angle_esd<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.05 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;110.14 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;110.73 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;119.98 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;117.67 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.52 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.45 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;117.64 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;117.63 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.56 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.15 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;120.00 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.48 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.47 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;120.00 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.69 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.72 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;108.19 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.73 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.72 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.78 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.74 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.71 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.80 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.71 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.70 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HH1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.49 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.74 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.69 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;109.47 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.97 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.93 3.0<BR>

&gt;&gt; CME &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;107.94 3.0<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; loop_<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.comp_id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.atom_id_1<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.atom_id_2<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.atom_id_3<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.atom_id_4<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.value_angle<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.value_angle_esd<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_tor.period<BR>

&gt;&gt; CME Var_01 &nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;133.07 &nbsp;30.0 2<BR>

&gt;&gt; CME Var_02 &nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;179.49 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_03 &nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;58.80 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_04 &nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-105.59 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_05 &nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;161.56 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_06 &nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-172.66 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_07 &nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;177.33 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_08 &nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;45.37 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_09 &nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-45.35 &nbsp;30.0 2<BR>

&gt;&gt; CME Var_10 &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-58.63 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_11 &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;57.60 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_12 &nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-165.67 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_13 &nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-45.66 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_14 &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-179.32 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_15 &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-63.09 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_16 &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;O &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;13.41 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_17 &nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;72.63 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_18 &nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-167.36 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_19 &nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;75.99 &nbsp;30.0 2<BR>

&gt;&gt; CME Var_20 &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-60.78 &nbsp;30.0 2<BR>

&gt;&gt; CME Var_21 &nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;55.43 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_22 &nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-60.81 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_23 &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;39.69 &nbsp;30.0 1<BR>

&gt;&gt; CME Var_24 &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SG &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-76.55 &nbsp;30.0 1<BR>

&gt;&gt; CME Var_25 &nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;167.25 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_26 &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;SD &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-76.51 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_27 &nbsp;HH1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;173.81 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_28 &nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;167.31 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_29 &nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-76.51 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_30 &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-46.26 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_31 &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;H2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;73.74 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_32 &nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HC1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-165.01 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_33 &nbsp;HB2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;61.10 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_34 &nbsp;HB3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;177.33 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_35 &nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-70.81 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_36 &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;45.43 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_37 &nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;45.37 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_38 &nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CE &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HE3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;161.61 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_39 &nbsp;HH1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HZ2 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;51.95 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; CME Var_40 &nbsp;HH1 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;OH &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CZ &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;HZ3 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;-64.25 &nbsp;30.0 3<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; loop_<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.comp_id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.id<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.atom_id_centre<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.atom_id_1<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.atom_id_2<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.atom_id_3<BR>

&gt;&gt; _chem_comp_chir.volume_sign<BR>

&gt;&gt; CME chir_01 &nbsp;&nbsp;CA &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;N &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;C &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;CB &nbsp;&nbsp;&nbsp;both<BR>

&gt;&gt; #<BR>

&gt;&gt; _______________________________________________<BR>

&gt;&gt; phenixbb mailing list<BR>

&gt;&gt; <a href="phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><BR>

&gt;&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><BR>

&gt;&gt;<BR>

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_______________________________________________<BR>

phenixbb mailing list<BR>

<a href="phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><BR>

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