<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
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    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Donnie,<br>
    <br>
    Coot is not a part of PHENIX and is not distributed with PHENIX.
    PHENIX can use Coot if it is available (installed separately by the
    user).<br>
    <br>
    Pavel.<br>
    <br>
    On 3/10/11 7:26 PM, Donnie Berkholz wrote:
    <blockquote cite="mid:20110311032611.GA768@comet" type="cite">
      <pre wrap="">On 17:15 Thu 10 Mar     , Stephen Graham wrote:
</pre>
      <blockquote type="cite">
        <pre wrap="">Hi there,

I'd like to average 2Fo-Fc maps from 2 (approximately) isomorphous
data sets (one with ligand, one without) to see whether I get better
density for some of the noisier bits of the structure.  I don't want
to do any kind of solvent flattening, histogram matching, cyclical
averaging, etc; I just want to sum the equivalent pixels and divide by
2.

Is it possible to do this easily using any of the phenix tools?  It
seems like all the required plumbing is there with get_cc_mtz_mtz or
superpose_maps, but I can't find a phenix utility for averaging two
superposed maps.
</pre>
      </blockquote>
      <pre wrap="">
Well, Coot is distributed with phenix so I guess you could call it a 
phenix tool. You can use tools in Extensions-&gt;Maps to first superpose 
the maps (transform by LSQ fit), then average them.

</pre>
      <pre wrap="">
<fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
_______________________________________________
phenixbb mailing list
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</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>