<div class="im"><b style="color: rgb(255, 0, 0);"><font size="4">Xtrige log file of P21 </font></b><br></div><div><br><div class="im"><br>The full list of Patterson peaks is: <br><br>&nbsp; x&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; y&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; z&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; height&nbsp;&nbsp; p-value(height)<br>
</div></div><div class="im">( 0.500, 0.500, 0.000 ) :&nbsp;&nbsp; 56.002&nbsp;&nbsp; (2.915e-05)<br></div>

( 0.483, 0.500, 0.034 ) :&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.152&nbsp;&nbsp; (6.778e-01)<div class="im"><div><br><br>&nbsp;If the observed pseudo translationals are crystallographic<br>&nbsp;the following spacegroups and unit cells are possible: <br><br>&nbsp;space group&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; operator&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; unit cell of reference setting&nbsp; <br>

</div></div><div class="im">
&nbsp;C 1 2 1 (a-1/4,b-1/4,c)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; x+1/2, y+1/2, z&nbsp; (186.38, 103.16, 295.88,&nbsp; 90.00, 98.79, 90.00)<br><b style="color: rgb(255, 0, 0);"><font size="4"><br>Xtrige log file of P2</font></b><font size="4"> </font><br></div><div class="im">
<div>
<br>The full list of Patterson peaks is: <br></div></div><div class="im">
The Xtrige log is as follows,</div><div><br><div class="im">&nbsp; x&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; y&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; z&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; height&nbsp;&nbsp; p-value(height)<br></div></div><div class="im">( 0.500, 0.500, 0.000 ) :&nbsp;&nbsp; 56.000&nbsp;&nbsp; (2.916e-05)<br></div>( 0.483, 0.500, 0.034 ) :&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.151&nbsp;&nbsp; (6.781e-01)<div class="im">
<div>
<br><br>&nbsp;If the observed pseudo translationals are crystallographic<br>
&nbsp;the following spacegroups and unit cells are possible: <br><br>&nbsp;space group&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; operator&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; unit cell of reference setting&nbsp; <br></div></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; C 1 2 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; x+1/2, y+1/2, z&nbsp; (186.38, 103.16, 295.88,&nbsp; 90.00, 98.79, 90.00)<br>


<br><br><font size="4"><b><span style="color: rgb(255, 0, 0);">Results from rotation functions for P2 (Search two monomers in ASU)</span></b><br><br></font>******************************</div><div><div class="im">*******************************************************<br>


*** Phaser Module: MOLECULAR REPLACEMENT FAST ROTATION FUNCTION&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.2.4 ***<br>*************************************************************************************<br><br>---------------------<br>ANISOTROPY CORRECTION<br>


---------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; No refinement of parameters<br><br>-------------------------------<br>DATA FOR FAST ROTATION FUNCTION<br>-------------------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Outliers with a probability less than 1e-06 will be rejected<br>


&nbsp;&nbsp; There were 2 (0.0000%) reflections rejected<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; H&nbsp;&nbsp;&nbsp; K&nbsp;&nbsp;&nbsp; L&nbsp;&nbsp; reso&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; probability<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp; 62&nbsp;&nbsp; 4.48&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.404&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.049e-07<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; -26&nbsp;&nbsp; 8.12&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112.092&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.520e-09<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Space-Group Name (Number):&nbsp;&nbsp; P 1 2 1 (3)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of All Data (Number):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.82 49.18 (87989)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of Selected Data (Number):&nbsp; 3.82 49.18 (87985)<br><br>--------------------------<br>ENSEMBLE FOR DECOMPOSITION<br>


--------------------------<br><br></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br>
&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 394.48&nbsp; 295.80&nbsp; 293.03&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>-------------------<br>WILSON DISTRIBUTION<br>-------------------<br><br>


&nbsp;&nbsp; Parameters set for Wilson log-likelihood calculation<br>&nbsp;&nbsp; E = 0 and variance 1 for each reflection<br>&nbsp;&nbsp; Without correction for SigF to the variances,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = - number of acentrics (83981)<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; - half number of centrics (4004/2)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -85983<br>&nbsp;&nbsp; With correction for SigF,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = -89650.5<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Configuring ensembles<br>


&nbsp;&nbsp; ---------------------<br></div><div><div><span id="q_12ebbf4b7a6ac20f_20" class="h4"><br></span></div><div class="h5">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br>

&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 914.73&nbsp; 520.03&nbsp; 508.93&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>------------------------------<br>FAST ROTATION FUNCTION #1 OF 1<br>------------------------------<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Search Ensemble: 1<br>&nbsp;&nbsp; Known MR solutions<br>&nbsp;&nbsp; (empty solution set - no components)<br><br>&nbsp;&nbsp; Fraction of asymmetric unit modelled: 1.0047<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; of which the &quot;moving&quot; fraction is 1.0047<br><br>&nbsp;&nbsp; Fraction of asymmetric unit modelled (after correction): 0.99<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; of which the &quot;moving&quot; fraction is 0.99<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Spherical Harmonics<br>&nbsp;&nbsp; -------------------<br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Data<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Data<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |=========================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |===========================================================================| DONE<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Scanning the Range of Beta Angles<br>&nbsp;&nbsp; ---------------------------------<br>&nbsp;&nbsp; Performing a 1.3513 degree search.<br>&nbsp;&nbsp; Clmn Calculation<br>


&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |====================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Top 59 rotations before clustering will be rescored<br>


&nbsp;&nbsp; Calculating Likelihood for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |============================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Scoring 500 randomly sampled rotations<br>


&nbsp;&nbsp; Generating Statistics for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |========================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean Score (Sigma):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -7144.27&nbsp;&nbsp; (152.138)<br>


&nbsp;&nbsp; Highest Score (Z-score):&nbsp; -2269.9&nbsp;&nbsp; (32.0392)<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Top Peaks With Clustering<br>&nbsp;&nbsp; -------------------------<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak after rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak before rescoring search points<br>


&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Log-Likelihood Gain<br>&nbsp;&nbsp; Z-Score Number of standard deviations of LLG above the mean<br>&nbsp;&nbsp; FSS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Fast Search Score<br><br>&nbsp;&nbsp; You requested peaks over 75% of top (i.e. 0.75*(top-mean)+mean)<br>&nbsp;&nbsp; There was 1 site over 75% of top<br>


&nbsp;&nbsp; The sites over 75% are:<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp; Euler1 Euler2 Euler3&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp; Z-score Split #Group&nbsp;&nbsp; raw/top&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 326.1&nbsp;&nbsp; 62.4&nbsp;&nbsp; 83.0 -2269.90&nbsp;&nbsp; 32.04&nbsp;&nbsp; 0.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 23 100.0/100.0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 213.9&nbsp; 117.6&nbsp; 263.0</div>
</div><div>
<br>
<br><br><div class="im"><br>&nbsp;&nbsp; Fast Rotation Function Table: 1<br>&nbsp;&nbsp; -------------------------------<br>&nbsp;&nbsp; #SET&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Top&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Second&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Third&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)<br></div></div>&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -2269.90&nbsp; 32.04&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---<br>


&nbsp;&nbsp; ---- ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----<br><br>---------------<br>FINAL SELECTION<br>---------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean used for final selection = -7144.27<br>&nbsp;&nbsp; Cutoff used for final selection = -3488.49<div class="im">
<div>
<br>
&nbsp;&nbsp; Number of sets stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br>&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br>


<br></div></div><div class="im">------------<br><br style="color: rgb(255, 0, 0);"><b><font style="color: rgb(255, 0, 0);" size="4">Results from rotation functions for P2 (Search one monomer in ASU)</font></b><br><br>*************************************************************************************<br>


*** Phaser Module: MOLECULAR REPLACEMENT FAST ROTATION FUNCTION&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.2.4 ***<br>*************************************************************************************<br><br>---------------------<br>ANISOTROPY CORRECTION<br>


---------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; No refinement of parameters<br><br>-------------------------------<br>DATA FOR FAST ROTATION FUNCTION<br>-------------------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Outliers with a probability less than 1e-06 will be rejected<br>


&nbsp;&nbsp; There were 2 (0.0000%) reflections rejected<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; H&nbsp;&nbsp;&nbsp; K&nbsp;&nbsp;&nbsp; L&nbsp;&nbsp; reso&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; probability<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp; 62&nbsp;&nbsp; 4.48&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.404&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.049e-07<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; -26&nbsp;&nbsp; 8.12&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112.092&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.520e-09<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Space-Group Name (Number):&nbsp;&nbsp; P 1 2 1 (3)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of All Data (Number):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.82 49.18 (87989)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of Selected Data (Number):&nbsp; 3.82 49.18 (87985)<br><br>--------------------------<br>ENSEMBLE FOR DECOMPOSITION<br>


--------------------------<br><br></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br></div>
&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 323.84&nbsp; 274.82&nbsp; 261.37&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<div class="im"><br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>-------------------<br>WILSON DISTRIBUTION<br>-------------------<br>
<br>

&nbsp;&nbsp; Parameters set for Wilson log-likelihood calculation<br>&nbsp;&nbsp; E = 0 and variance 1 for each reflection<br>&nbsp;&nbsp; Without correction for SigF to the variances,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = - number of acentrics (83981)<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; - half number of centrics (4004/2)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -85983<br>&nbsp;&nbsp; With correction for SigF,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = -89650.5<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Configuring ensembles<br>


&nbsp;&nbsp; ---------------------<br></div><div><div><span id="q_12ebbf4b7a6ac20f_29" class="h4">- ��ʾ�������� -</span></div><div class="h5">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br>

&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 714.35&nbsp; 518.29&nbsp; 464.48&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>------------------------------<br>FAST ROTATION FUNCTION #1 OF 1<br>------------------------------<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Search Ensemble: 1<br>&nbsp;&nbsp; Known MR solutions<br>&nbsp;&nbsp; (empty solution set - no components)<br><br>&nbsp;&nbsp; Fraction of asymmetric unit modelled: 0.831924<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; of which the &quot;moving&quot; fraction is 0.831924<br><br>

<br>
&nbsp;&nbsp; Spherical Harmonics<br>&nbsp;&nbsp; -------------------<br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Data<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Data<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=========================================================================| DONE<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |===========================================================================| DONE<br>


<br><br>&nbsp;&nbsp; Scanning the Range of Beta Angles<br>&nbsp;&nbsp; ---------------------------------<br>&nbsp;&nbsp; Performing a 1.5476 degree search.<br>&nbsp;&nbsp; Clmn Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |===========================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Top 41 rotations before clustering will be rescored<br>&nbsp;&nbsp; Calculating Likelihood for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |==========================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Scoring 500 randomly sampled rotations<br>&nbsp;&nbsp; Generating Statistics for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |========================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean Score (Sigma):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -4412.88&nbsp;&nbsp; (151.158)<br>&nbsp;&nbsp; Highest Score (Z-score):&nbsp; -893.783&nbsp;&nbsp; (23.2809)<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Top Peaks With Clustering<br>


&nbsp;&nbsp; -------------------------<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak after rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak before rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Log-Likelihood Gain<br>&nbsp;&nbsp; Z-Score Number of standard deviations of LLG above the mean<br>


&nbsp;&nbsp; FSS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Fast Search Score<br><br>&nbsp;&nbsp; You requested peaks over 75% of top (i.e. 0.75*(top-mean)+mean)<br>&nbsp;&nbsp; There was 1 site over 75% of top<br>&nbsp;&nbsp; The sites over 75% are:<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp; Euler1 Euler2 Euler3&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp; Z-score Split #Group&nbsp;&nbsp; raw/top&nbsp; <br>


&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 70.6&nbsp;&nbsp; 39.1&nbsp;&nbsp; 10.6 -893.78&nbsp;&nbsp; 23.28&nbsp;&nbsp; 0.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 13 100.0/100.0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 109.4&nbsp; 140.9&nbsp; 190.6</div></div><div><br><br><br><div class="im"><br>&nbsp;&nbsp; Fast Rotation Function Table: 1<br>&nbsp;&nbsp; -------------------------------<br>

&nbsp;&nbsp; #SET&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Top&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Second&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Third&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)<br></div></div>
&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -893.78&nbsp; 23.28&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---<br>&nbsp;&nbsp; ---- ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----<br><br>---------------<br>FINAL SELECTION<br>---------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean used for final selection = -4412.88<br>


&nbsp;&nbsp; Cutoff used for final selection = -1773.56<div class="im"><div><br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br>


&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br><br></div></div><div class="im">------------<br><br>
<font size="4"><span style="color: rgb(204, 0, 0);">Results from rotation functions for P21 (Search two monomers in ASU)</span><br>
</font><br>*************************************************************************************<br>*** Phaser Module: MOLECULAR REPLACEMENT FAST ROTATION FUNCTION&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.2.4 ***<br>*************************************************************************************<br>


<br>---------------------<br>ANISOTROPY CORRECTION<br>---------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; No refinement of parameters<br><br>-------------------------------<br>DATA FOR FAST ROTATION FUNCTION<br>-------------------------------<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Outliers with a probability less than 1e-06 will be rejected<br>&nbsp;&nbsp; There were 2 (0.0000%) reflections rejected<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; H&nbsp;&nbsp;&nbsp; K&nbsp;&nbsp;&nbsp; L&nbsp;&nbsp; reso&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; probability<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp; 62&nbsp;&nbsp; 4.48&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.404&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.046e-07<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; -26&nbsp;&nbsp; 8.12&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112.092&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.516e-09<br><br>&nbsp;&nbsp; Space-Group Name (Number):&nbsp;&nbsp; P 1 21 1 (4)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of All Data (Number):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.82 49.18 (87983)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of Selected Data (Number):&nbsp; 3.82 49.18 (87981)<br>


<br>--------------------------<br>ENSEMBLE FOR DECOMPOSITION<br>--------------------------<br><br></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br>


&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 323.83&nbsp; 274.82&nbsp; 261.37&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>-------------------<br>WILSON DISTRIBUTION<br>-------------------<br><br>


&nbsp;&nbsp; Parameters set for Wilson log-likelihood calculation<br>&nbsp;&nbsp; E = 0 and variance 1 for each reflection<br>&nbsp;&nbsp; Without correction for SigF to the variances,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = - number of acentrics (83976)<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; - half number of centrics (4005/2)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -85978<br>&nbsp;&nbsp; With correction for SigF,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = -89646.3<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Configuring ensembles<br>


&nbsp;&nbsp; ---------------------<br></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br></div><div><div><span id="q_12ebbf4b7a6ac20f_37" class="h4"><br>
</span></div><div class="h5">
&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 714.35&nbsp; 518.29&nbsp; 464.48&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>------------------------------<br>FAST ROTATION FUNCTION #1 OF 1<br>------------------------------<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Search Ensemble: 1<br>&nbsp;&nbsp; Known MR solutions<br>&nbsp;&nbsp; (empty solution set - no components)<br><br>&nbsp;&nbsp; Fraction of asymmetric unit modelled: 0.737308<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; of which the &quot;moving&quot; fraction is 0.737308<br><br>

<br>
&nbsp;&nbsp; Spherical Harmonics<br>&nbsp;&nbsp; -------------------<br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Data<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Data<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=========================================================================| DONE<br>


<br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |===========================================================================| DONE<br>


<br><br>&nbsp;&nbsp; Scanning the Range of Beta Angles<br>&nbsp;&nbsp; ---------------------------------<br>&nbsp;&nbsp; Performing a 1.54708 degree search.<br>&nbsp;&nbsp; Clmn Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |===========================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Top 47 rotations before clustering will be rescored<br>&nbsp;&nbsp; Calculating Likelihood for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Scoring 500 randomly sampled rotations<br>&nbsp;&nbsp; Generating Statistics for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |========================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean Score (Sigma):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -3258.27&nbsp;&nbsp; (128.907)<br>&nbsp;&nbsp; Highest Score (Z-score):&nbsp; -242.259&nbsp;&nbsp; (23.3968)<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Top Peaks With Clustering<br>


&nbsp;&nbsp; -------------------------<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak after rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak before rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Log-Likelihood Gain<br>&nbsp;&nbsp; Z-Score Number of standard deviations of LLG above the mean<br>


&nbsp;&nbsp; FSS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Fast Search Score<br><br>&nbsp;&nbsp; You requested peaks over 75% of top (i.e. 0.75*(top-mean)+mean)<br>&nbsp;&nbsp; There was 1 site over 75% of top<br>&nbsp;&nbsp; The sites over 75% are:<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp; Euler1 Euler2 Euler3&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp; Z-score Split #Group&nbsp;&nbsp; raw/top&nbsp; <br>


&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 70.7&nbsp;&nbsp; 39.1&nbsp;&nbsp; 10.6 -242.26&nbsp;&nbsp; 23.40&nbsp;&nbsp; 0.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18 100.0/100.0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 109.3&nbsp; 140.9&nbsp; 190.6</div></div><div><br><br><br><div class="im"><br>&nbsp;&nbsp; Fast Rotation Function Table: 1<br>&nbsp;&nbsp; -------------------------------<br>

&nbsp;&nbsp; #SET&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Top&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Second&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Third&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)<br></div></div>
&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -242.26&nbsp; 23.40&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---<br>&nbsp;&nbsp; ---- ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----<br><br>---------------<br>FINAL SELECTION<br>---------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean used for final selection = -3258.27<br>


&nbsp;&nbsp; Cutoff used for final selection = -996.261<div class="im"><div><br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br>


&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br><br></div></div><div class="im">------------<br>
<br style="color: rgb(204, 0, 0);">
<font style="color: rgb(204, 0, 0);" size="4">Results from rotation functions for P21 (Search One monomers in ASU)</font><br><br>*************************************************************************************<br>*** Phaser Module: MOLECULAR REPLACEMENT FAST ROTATION FUNCTION&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.2.4 ***<br>


*************************************************************************************<br><br>---------------------<br>ANISOTROPY CORRECTION<br>---------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; No refinement of parameters<br><br>-------------------------------<br>


DATA FOR FAST ROTATION FUNCTION<br>-------------------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Outliers with a probability less than 1e-06 will be rejected<br>&nbsp;&nbsp; There were 2 (0.0000%) reflections rejected<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; H&nbsp;&nbsp;&nbsp; K&nbsp;&nbsp;&nbsp; L&nbsp;&nbsp; reso&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; probability<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp; 62&nbsp;&nbsp; 4.48&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.404&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.046e-07<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; -26&nbsp;&nbsp; 8.12&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 112.092&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.516e-09<br><br>&nbsp;&nbsp; Space-Group Name (Number):&nbsp;&nbsp; P 1 21 1 (4)<br>&nbsp;&nbsp; Resolution of All Data (Number):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.82 49.18 (87983)<br>


&nbsp;&nbsp; Resolution of Selected Data (Number):&nbsp; 3.82 49.18 (87981)<br><br>--------------------------<br>ENSEMBLE FOR DECOMPOSITION<br>--------------------------<br><br></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br>
&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 323.83&nbsp; 274.82&nbsp; 261.37&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br><br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>
&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br><br>-------------------<br>WILSON DISTRIBUTION<br>-------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Parameters set for Wilson log-likelihood calculation<br>&nbsp;&nbsp; E = 0 and variance 1 for each reflection<br>


&nbsp;&nbsp; Without correction for SigF to the variances,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = - number of acentrics (83976)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; - half number of centrics (4005/2)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -85978<br>


&nbsp;&nbsp; With correction for SigF,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Wilson log(likelihood) = -89646.3<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Configuring ensembles<br>&nbsp;&nbsp; ---------------------<br></div><div class="im">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; This pdb file contains 1 models<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The (input) RmsD of this model with respect to the real structure is 0.8<br></div><div><div><span id="q_12ebbf4b7a6ac20f_45" class="h4"><br></span></div><div class="h5">&nbsp;&nbsp; Unit Cell:&nbsp; 714.35&nbsp; 518.29&nbsp; 464.48&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00&nbsp;&nbsp; 90.00<br>
<br>&nbsp;&nbsp; Electron Density Calculation<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |=======| DONE<br>

<br>------------------------------<br>FAST ROTATION FUNCTION #1 OF 1<br>------------------------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Search Ensemble: 1<br>&nbsp;&nbsp; Known MR solutions<br>&nbsp;&nbsp; (empty solution set - no components)<br><br>&nbsp;&nbsp; Fraction of asymmetric unit modelled: 0.737308<br>


&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; of which the &quot;moving&quot; fraction is 0.737308<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Spherical Harmonics<br>&nbsp;&nbsp; -------------------<br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Data<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Data<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |=========================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Elmn for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; Elmn Calculation for Search Ensemble<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |===========================================================================| DONE<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Scanning the Range of Beta Angles<br>&nbsp;&nbsp; ---------------------------------<br>&nbsp;&nbsp; Performing a 1.54708 degree search.<br>&nbsp;&nbsp; Clmn Calculation<br>


&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |===========================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Top 47 rotations before clustering will be rescored<br>&nbsp;&nbsp; Calculating Likelihood for RF #1 of 1<br>


&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>&nbsp;&nbsp; |================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Scoring 500 randomly sampled rotations<br>&nbsp;&nbsp; Generating Statistics for RF #1 of 1<br>&nbsp;&nbsp; 0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100%<br>


&nbsp;&nbsp; |========================================================================| DONE<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean Score (Sigma):&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -3258.27&nbsp;&nbsp; (128.907)<br>&nbsp;&nbsp; Highest Score (Z-score):&nbsp; -242.259&nbsp;&nbsp; (23.3968)<br><br><br>&nbsp;&nbsp; Top Peaks With Clustering<br>


&nbsp;&nbsp; -------------------------<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak after rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Rank of the peak before rescoring search points<br>&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Log-Likelihood Gain<br>&nbsp;&nbsp; Z-Score Number of standard deviations of LLG above the mean<br>


&nbsp;&nbsp; FSS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Fast Search Score<br><br>&nbsp;&nbsp; You requested peaks over 75% of top (i.e. 0.75*(top-mean)+mean)<br>&nbsp;&nbsp; There was 1 site over 75% of top<br>&nbsp;&nbsp; The sites over 75% are:<br>&nbsp;&nbsp; #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; (#)&nbsp;&nbsp; Euler1 Euler2 Euler3&nbsp;&nbsp; LLG&nbsp;&nbsp; Z-score Split #Group&nbsp;&nbsp; raw/top&nbsp; <br>


&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 70.7&nbsp;&nbsp; 39.1&nbsp;&nbsp; 10.6 -242.26&nbsp;&nbsp; 23.40&nbsp;&nbsp; 0.0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18 100.0/100.0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 109.3&nbsp; 140.9&nbsp; 190.6</div></div><div><br><br><br><div class="im"><br>&nbsp;&nbsp; Fast Rotation Function Table: 1<br>&nbsp;&nbsp; -------------------------------<br>

&nbsp;&nbsp; #SET&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Top&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Second&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Third&nbsp;&nbsp;&nbsp; (Z)<br></div></div>
&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -242.26&nbsp; 23.40&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---<br>&nbsp;&nbsp; ---- ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----&nbsp; ----------&nbsp; -----<br><br>---------------<br>FINAL SELECTION<br>---------------<br><br>&nbsp;&nbsp; Mean used for final selection = -3258.27<br>


&nbsp;&nbsp; Cutoff used for final selection = -996.261<div class="im"><div><br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored before final selection = 1<br>&nbsp;&nbsp; Number of sets stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br>


&nbsp;&nbsp; Number of solutions stored (deleted) after final selection = 1 (0)<br><br></div></div>------------<br><br><br><br><b><font size="4">Thanks a lot.<br><br>Yu<br></font></b></div><br><br><div class="gmail_quote">2011/3/15 Francis E Reyes <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Francis.Reyes@colorado.edu">Francis.Reyes@colorado.edu</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Go back to your xtriage log file... Post the section that looks similar to the one below...<br>

<br>
The full list of Patterson peaks is:<br>
<br>
 &nbsp;x &nbsp; &nbsp; &nbsp;y &nbsp; &nbsp; &nbsp;z &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;height &nbsp; p-value(height)<br>
( 0.500, 0.000, 0.233 ) : &nbsp; 26.198 &nbsp; (2.753e-03)<br>
( 0.000, 0.338, 0.000 ) : &nbsp; &nbsp;5.699 &nbsp; (7.800e-01)<br>
<br>
&nbsp;If the observed pseudo translationals are crystallographic<br>
&nbsp;the following spacegroups and unit cells are possible:<br>
<br>
&nbsp;space group &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;operator &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; unit cell of reference setting<br>
 &nbsp;C 2 2 21 (-a,c,2*b) &nbsp; &nbsp; &nbsp; x+1/2, y, z+1/4 &nbsp;(55.47, 73.64, 81.46, &nbsp;90.00, 90.00, 90.00)<br>
<br>
<br>
<br>
Systematic absences<br>
<br>
<br>
Also, post the results of the rotation function.. What is the RFZ score and how did it compare to any other rotation solutions.<br><font color="#888888">
<br>
<br>
F</font><div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
<br>
<br>
On Mar 15, 2011, at 1:13 PM, Zhang yu wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<br>
It indicates that pseudo translational symmetry is present in the dataset. I didn&#39;t do anything when I first try MR. Is that possible I merged two lattice together during data process, or should I reprocess the data to P1?<br>

<br>
I attached the scale log file,<br>
<br>
&nbsp;Shell Lower Upper Average &nbsp; &nbsp; &nbsp;Average &nbsp; &nbsp; Norm. Linear Square<br>
&nbsp;limit &nbsp; &nbsp;Angstrom &nbsp; &nbsp; &nbsp; I &nbsp; error &nbsp; stat. Chi**2 &nbsp;R-fac &nbsp;R-fac<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp;50.00 &nbsp;10.29 &nbsp;1030.9 &nbsp; &nbsp;76.3 &nbsp; &nbsp;20.0 &nbsp;1.095 &nbsp;0.105 &nbsp;0.118<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp;10.29 &nbsp; 8.18 &nbsp; 791.3 &nbsp; &nbsp;52.2 &nbsp; &nbsp;18.1 &nbsp;1.108 &nbsp;0.093 &nbsp;0.101<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 8.18 &nbsp; 7.15 &nbsp; 350.8 &nbsp; &nbsp;23.5 &nbsp; &nbsp;11.3 &nbsp;1.160 &nbsp;0.108 &nbsp;0.106<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 7.15 &nbsp; 6.49 &nbsp; 195.8 &nbsp; &nbsp;17.1 &nbsp; &nbsp;11.4 &nbsp;1.090 &nbsp;0.138 &nbsp;0.131<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 6.49 &nbsp; 6.03 &nbsp; 143.7 &nbsp; &nbsp;15.7 &nbsp; &nbsp;12.1 &nbsp;1.029 &nbsp;0.167 &nbsp;0.154<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 6.03 &nbsp; 5.67 &nbsp; 130.8 &nbsp; &nbsp;15.6 &nbsp; &nbsp;13.2 &nbsp;1.101 &nbsp;0.187 &nbsp;0.173<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 5.67 &nbsp; 5.39 &nbsp; 129.9 &nbsp; &nbsp;16.8 &nbsp; &nbsp;14.6 &nbsp;1.074 &nbsp;0.198 &nbsp;0.184<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 5.39 &nbsp; 5.16 &nbsp; 136.0 &nbsp; &nbsp;17.9 &nbsp; &nbsp;15.6 &nbsp;1.078 &nbsp;0.202 &nbsp;0.186<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 5.16 &nbsp; 4.96 &nbsp; 138.3 &nbsp; &nbsp;19.2 &nbsp; &nbsp;16.8 &nbsp;1.044 &nbsp;0.207 &nbsp;0.192<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.96 &nbsp; 4.79 &nbsp; 150.9 &nbsp; &nbsp;20.7 &nbsp; &nbsp;18.0 &nbsp;1.082 &nbsp;0.209 &nbsp;0.191<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.79 &nbsp; 4.64 &nbsp; 151.3 &nbsp; &nbsp;21.1 &nbsp; &nbsp;18.8 &nbsp;1.140 &nbsp;0.225 &nbsp;0.210<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.64 &nbsp; 4.50 &nbsp; 143.1 &nbsp; &nbsp;22.4 &nbsp; &nbsp;20.3 &nbsp;1.070 &nbsp;0.236 &nbsp;0.226<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.50 &nbsp; 4.39 &nbsp; 127.5 &nbsp; &nbsp;22.5 &nbsp; &nbsp;21.1 &nbsp;1.027 &nbsp;0.262 &nbsp;0.251<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.39 &nbsp; 4.28 &nbsp; 117.7 &nbsp; &nbsp;22.8 &nbsp; &nbsp;22.3 &nbsp;1.051 &nbsp;0.291 &nbsp;0.279<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.28 &nbsp; 4.18 &nbsp; 105.8 &nbsp; &nbsp;24.2 &nbsp; &nbsp;23.7 &nbsp;0.988 &nbsp;0.322 &nbsp;0.317<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.18 &nbsp; 4.09 &nbsp; &nbsp;93.0 &nbsp; &nbsp;25.0 &nbsp; &nbsp;24.9 &nbsp;0.947 &nbsp;0.365 &nbsp;0.371<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.09 &nbsp; 4.01 &nbsp; &nbsp;84.9 &nbsp; &nbsp;25.3 &nbsp; &nbsp;25.2 &nbsp;0.884 &nbsp;0.409 &nbsp;0.403<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.01 &nbsp; 3.94 &nbsp; &nbsp;76.6 &nbsp; &nbsp;27.4 &nbsp; &nbsp;27.3 &nbsp;0.843 &nbsp;0.457 &nbsp;0.490<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 3.94 &nbsp; 3.87 &nbsp; &nbsp;66.5 &nbsp; &nbsp;27.5 &nbsp; &nbsp;27.5 &nbsp;0.778 &nbsp;0.505 &nbsp;0.559<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 3.87 &nbsp; 3.80 &nbsp; &nbsp;59.3 &nbsp; &nbsp;28.9 &nbsp; &nbsp;28.8 &nbsp;0.766 &nbsp;0.575 &nbsp;0.696<br>
 &nbsp;All reflections &nbsp; &nbsp;222.9 &nbsp; &nbsp;26.7 &nbsp; &nbsp;19.5 &nbsp;1.037 &nbsp;0.165 &nbsp;0.128<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
2011/3/15 Francis E Reyes &lt;<a href="mailto:Francis.Reyes@colorado.edu" target="_blank">Francis.Reyes@colorado.edu</a>&gt;<br>
This is probably the most revealing to me.. What did you do about this when you did the MR?<br>
<br>
<br>
On Mar 15, 2011, at 9:45 AM, Zhang yu wrote:<br>
<br>
The analyses of the Patterson function reveals a significant off-origin<br>
peak that is 56.00 % of the origin peak, indicating pseudo translational symmetry.<br>
<br>
---------------------------------------------<br>
Francis E. Reyes M.Sc.<br>
215 UCB<br>
University of Colorado at Boulder<br>
<br>
gpg --keyserver <a href="http://pgp.mit.edu" target="_blank">pgp.mit.edu</a> --recv-keys 67BA8D5D<br>
<br>
8AE2 F2F4 90F7 9640 28BC &nbsp;686F 78FD 6669 67BA 8D5D<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</blockquote>
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Francis E. Reyes M.Sc.<br>
215 UCB<br>
University of Colorado at Boulder<br>
<br>
gpg --keyserver <a href="http://pgp.mit.edu" target="_blank">pgp.mit.edu</a> --recv-keys 67BA8D5D<br>
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8AE2 F2F4 90F7 9640 28BC &nbsp;686F 78FD 6669 67BA 8D5D<br>
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