<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
    <title></title>
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi,<br>
    <br>
    isn't it (or a simple derivative of) what phenix.refine outputs all
    the time, see log file for lines like this:<br>
    <br>
    | x-ray target function (ml) for work reflections:
    4.379227&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<br>
    <br>
    where ML target function is defined here:<br>
    Acta Cryst. (1995). A51, 880-887<br>
    <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate;
      color: rgb(0, 0, 0); font-family: Times; font-style: normal;
      font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal;
      line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform:
      none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
      font-size: medium;"><span class="Apple-style-span"
        style="font-family: verdana,helvetica,arial,sans-serif;
        font-size: 14px;">Acta Cryst. (2002). A58, 270-282.<br>
        <br>
        I guess the above value is normalized by a number of reflections
        or something like this (I don't remember, but if you are
        interested let me know and I will have a look at the code). It
        may also not contain a constant part of the target.<span
          class="Apple-converted-space"> <br>
          <br>
          May be I should add it to phenix.model_vs_data output...<br>
        </span></span></span><br>
    Pavel.<br>
    <br>
    <blockquote
      cite="mid:39065.168.7.112.146.1304230601.squirrel@webmail.umbc.edu"
      type="cite">
      <pre wrap="">Hi,

Is there any way in phenix (such as phenix.refine) to evaluate the
LLG(log-likelihood) value by given the structure factor information only
(Fo, sigmaFo and Fc)? Thanks in advance for any information!

Best regards, Hailiang
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>