<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<style>
<!--
@font-face
        {font-family:"Cambria"}
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in 0in 10pt;
        font-size:12pt;
        font-family:"Times New Roman"}
-->
</style><style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Dear Hena,<br>
<br>
<font style="font-family: Arial; color: rgb(0, 0, 0);" size="2">a description of various transformations that are in use in crystallography and corresponding matrices can be found in the article
<br>
</font>
<h1 style="font-family: Arial; color: rgb(0, 0, 0); font-weight: normal;" class="doc">
<font size="2">Tcl/Tk-based programs. II. CONVROT: a program to recalculate different rotation descriptions
</font></h1>
<div id="docInfoBlock" class="docMetaBlock ">
<div id="docDetails">
<h5 style="font-family: Arial; color: rgb(0, 0, 0); font-weight: normal;" class="docAuthor">
<font size="2"><a href="http://www.deepdyve.com/search?author=Urzhumtseva%2C&#43;L.M" title="Author Search: Urzhumtseva, L.M">Urzhumtseva, L.M</a>;
<a href="http://www.deepdyve.com/search?author=Urzhumtsev%2C&#43;A.G" title="Author Search: Urzhumtsev, A.G">
Urzhumtsev, A.G</a></font> </h5>
<h6 style="font-family: Arial; color: rgb(0, 0, 0); font-weight: normal;" class="docMeta">
<font size="2"><strong class="source"><a class="followIcon notPermitted " href="http://www.deepdyve.com/lp/international-union-of-crystallography/tcl-tk-based-programs-ii-convrot-a-program-to-recalculate-different-2p0UINv8tV#0021-8898" title="Journal of Applied Crystallography"><span></span></a><a href="http://www.deepdyve.com/browse/journals/journal-of-applied-crystallography" title="Journal of Applied Crystallography">Journal
 of Applied Crystallography</a> </strong>, Volume 30 (3): 402 </font></h6>
With best regards,<br>
<br>
Sacha Urzhumtsev<br>
<br>
</div>
</div>
<br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 16px;">
<hr tabindex="-1">
<div style="direction: ltr;" id="divRpF199038"><font color="#000000" face="Tahoma" size="2"><b>De :</b> phenixbb-bounces@phenix-online.org [phenixbb-bounces@phenix-online.org] de la part de Hena Dutta [hdutta10@gmail.com]<br>
<b>Date d'envoi :</b> mercredi 25 mai 2011 20:41<br>
<b> :</b> PHENIX user mailing list<br>
<b>Objet :</b> [phenixbb] Equations of transformation<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<p class="MsoNormal">Dear Members,</p>
<p class="MsoNormal">Sorry, if my question is out of the field.<br>
</p>
<p class="MsoNormal">I want to know the mathematical relations between 2 sets of co-ordinates, one before and one after the rotation. I used COOT to rotate the side chain (containing atoms N1, C2, N3, &nbsp;C4, C5, C6, N6, N7 and C8) of Adenine by 180 degree about
 the glycosidic bond (C1-N9). How the initial co-ordinates (Xi, Yi, Zi) and final co-ordinates (Xf, Yf, Zf) are mathematically related? I shall be very grateful if someone can tell me the equations.&nbsp;
<span style=""><br>
</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="">Regards...</span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="">Hena<br>
</span></p>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>