<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi Intekhab,<br>
    <br>
    Autobuild uses phenix.refine internally, and phenix.refine creates
    the Fourier map coefficients you want 2mFo-DFc and mFo-DFc (which is
    not the same as 2fo-fc and fo-fc). So load that MTZ file into Coot
    that contains labels:<br>
    <br>
    2FOFCWT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
    PH2FOFCWT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
    2FOFCWT_no_fill&nbsp; <br>
    PH2FOFCWT_no_fill<br>
    FOFCWT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
    PHFOFCWT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
    <br>
    Pavel.<br>
    <br>
    On 8/7/11 10:19 PM, intekhab alam wrote:
    <blockquote
cite="mid:CA+-VYKU9mTROVSqmSaEneMAh1uVNJkprzxaMYkZ=j+wROVYSFA@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div>Hi there</div>
      <div><br clear="all">
        i run autobuild in phenix and have my model and mtz file.</div>
      <div>when i open my mtz file in coot using the option open mtz, a
        window pops " column label assignment"</div>
      <div>
        <div>How can i convert this mtz file that can open in coot&nbsp;which
          has both 2fo-fc as well as fo-fc maps.</div>
        <br>
        -- <br>
        INTEKHAB ALAM<br>
        LABORATORY OF STRUCTURAL BIOINFORMATICS<br>
        KOREA UNIVERSITY, SEOUL<br>
      </div>
      <pre wrap="">
<fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>