Hello,<br><br>I am trying to refine a surface cys that is alkylated by beta-mercaptoethanol (BME). The BME appears to have two poses and I am having trouble with getting phenix to understand the restraints.  When I give the BME two conformations I get the error:<br>
<br>Sorry: No atom selected: &quot;chain A and resname ABME and resid 165 and name S2&quot;<br><br>My link_params file looks like this:<br><br>refinement.geometry_restraints.edits {<br>  drgA_selection1 = chain A and resname ABME and resid 165 and name S2<br>
<br> bond {<br>    action = *add<br>    atom_selection_1 = $drgA_selection1<br>    atom_selection_2 = $cys215_selection<br>distance_ideal = 2.05<br>    sigma = 0.02<br>    slack = None<br>  }<br><br>Not calling it ABME of course results in a non-unique atom error.<br>
<br>Thanks for your help.<br><br>Matthew Merski<br>UCSF<br>Shoichet Group<br>