Hi Pietro,<div><br></div><div>Could you try again without the space after the comma:</div><div><br></div><div>xray_data.calc_labels=&quot;FCalc,PHICalc&quot;</div><div><br></div><div>Ralf<br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Oct 10, 2011 at 7:05 AM, Pietro Roversi <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:pietro.roversi@path.ox.ac.uk">pietro.roversi@path.ox.ac.uk</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">Dear all,<br>
<br>
I am trying to run phenix.xtriage to compute  Robs vs Rcalc for twinned data<br>
(from A. A. Lebedev, A. A. Vagin and G. N. Murshudov<br>
Intensity statistics in twinned crystals with examples from the PDB,<br>
Acta Crystallographica, D62, 83-95, (2006)<br>
<br>
My input:<br>
phenix.xtriage xray_data.file_name=$1.mtz xray_data.obs_labels=&quot;IMEAN, SIGIMEAN&quot; xray_data.calc_labels=&quot;FCalc, PHICalc&quot; xray_data.high_resolution=3.1 &gt; phenix.xtriage.$$.log<br>
<br>
The FCalc, PHICalc columns (from CCP4-sfall) are in my mtzfile:<br>
<br>
 1 ASC    -27      27      0  100.00      0.7     10.4  52.72   2.60   H  H<br>
   2 NONE   -90      90      0  100.00      0.7     34.2  52.72   2.60   H  K<br>
   3 NONE     0      15      0  100.00      5.7      5.7  52.72   2.60   H  L<br>
   4 NONE    0.0    19.0     0  100.00     9.50     9.50  52.72   2.60   I  FreeR_flag<br>
   5 NONE -244.3 13664.9     0  100.00   467.59   469.74  52.72   2.60   J  IMEAN<br>
   6 NONE    1.8   990.9     0  100.00    43.05    43.05  52.72   2.60   Q  SIGIMEAN<br>
   7 NONE   16.2  1157.9     0  100.00   173.14   173.14  52.72   2.60   F  F<br>
   8 NONE    1.7    51.3     0  100.00    12.91    12.91  52.72   2.60   Q  SIGF<br>
   9 NONE    0.7  7827.1     0  100.00   257.63   257.63  52.72   2.60   F  FCalc<br>
  10 NONE    0.0   360.0     0  100.00   180.24   180.24  52.72   2.60   P  PHICalc<br>
<br>
and yet I get the error message:<br>
creamint:~/Projects/FactorI/Tetartohedral/P1/DataFiles&gt; ~/Scripts/phenix_xtriage.csh AUTOMATIC_DEFAULT_free.klh_sfall1<br>
Running phenix.xtriage<br>
<br>
No matching array: scaling.input.xray_data.calc_labels=FCalc, PHICalc<br>
<br>
Possible choices:<br>
  AUTOMATIC_DEFAULT_free.klh_sfall1.mtz:IMEAN,SIGIMEAN<br>
  AUTOMATIC_DEFAULT_free.klh_sfall1.mtz:F,SIGF<br>
<br>
Please use scaling.input.xray_data.calc_labels<br>
to specify an unambiguous substring of the target label.<br>
<br>
Sorry: No matching array: scaling.input.xray_data.calc_labels=FCalc, PHICalc<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</blockquote></div><br></div>