<div class="gmail_quote"><div>Hi Michael,</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div style="word-wrap:break-word">I did notice that CCP4 6.2.0 outputs the mtz file with this column order:<div class="im">
<br>H K L FreeR_flag F_S13E_X2 SIGF_S13E_X2 DANO_S13E_X2 SIGDANO_S13E_X2 <br>F_S13E_X2(+) SIGF_S13E_X2(+) F_S13E_X2(-) SIGF_S13E_X2(-) ISYM_S13E_X2 <br>IMEAN_S13E_X2 SIGIMEAN_S13E_X2 I_S13E_X2(+) SIGI_S13E_X2(+) I_S13E_X2(-) <br>
SIGI_S13E_X2(-)<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>This new <font class="Apple-style-span" face="&#39;courier new&#39;, monospace">F,SIGF,DANO,SIGDANO</font> order explains why  the four MTZ columns are combined into an anomalous array. (The phenix tools have been doing this for many years.)</div>
<div><br></div><div>Is this an actual problem for you?</div><div><br></div><div>You could use <font class="Apple-style-span" face="&#39;courier new&#39;, monospace">phenix.reflection_file_convert --non-anomalous</font> to obtain a non-anomalous array.</div>
<div><br></div><div>In phenix.refine you can say <font class="Apple-style-span" face="&#39;courier new&#39;, monospace">force_anomalous_flag_to_be_equal_to=False</font>.</div><div><br></div><div>Ralf</div><div><br></div></div>