Hi,<br><br>Could you please tell me how I can measure angle between two helices. Can COOT or PYMOL measure this? <br>I have another question.<br><br>In PDBSET, I can use CHAIN command in shell script to write a pdb file with a desired chain ID. What is the command<br>
 in shell script to write a pdb file with a desired SEGID? As for example:-<br><br>pdbset xyzin start.pdb xyzout end.pdb &lt;&lt;eof &gt;&amp; pdbset.log<br>ROTATE [INVERT] [MATRIX] values<br>CHAIN A<br>end<br>eof <br><br>
This will change the chain ID to A after rotation. But, I also like to give a segid in the end coordinate.<br><br>Thank you in advance and have a nice THANKS GIVING WEEKEND<br><br>Hena<br>