<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>Dear All,</span></div><div><br><span></span></div><div><span>Interestingly, most of the bonds deviation are from Asn! Btween ND2 and HD21 or HD22.</span></div><div><br><span></span></div><div><span>I am looking forward to getting an explanation from you.</span></div><div><br><span></span></div><div><span>Cheers,</span></div><div><br><span></span></div><div><span>Dialing<br></span></div><div><br><span></span></div><div><span><br></span></div><div><br><span></span></div><div><span></span></div><div><br></div>  <div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"> <div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"> <font face="Arial" size="2"> ----- Forwarded Message -----<br>  <b><span style="font-weight: bold;">From:</span></b> Dialing Pretty
 &lt;hdc123hdc123@yahoo.com&gt;<br> <b><span style="font-weight: bold;">To:</span></b> "phenixbb@phenix-online.org" &lt;phenixbb@phenix-online.org&gt; <br> <b><span style="font-weight: bold;">Sent:</span></b> Tuesday, 6 December 2011 12:44 AM<br> <b><span style="font-weight: bold;">Subject:</span></b> bond deviation deected by Coot<br> </font> <br><meta http-equiv="x-dns-prefetch-control" content="off"><div id="yiv1276615896"><div><div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 12pt;"><div>Dear All,</div><div><br></div><div>After Pheneix refine, the quality of the structure improved significantly as analyzed by Molprobity. However the&nbsp; bond deviation increased significantly after the refinement. Will you please tell me which refine function can be used to reduce the bond deviation detected by the Coot geometry
 analysis?</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>Dialing</div></div></div></div><meta http-equiv="x-dns-prefetch-control" content="on"><br><br> </div> </div>  </div></body></html>