<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Dialing,<br>
    <br>
    for example, it may mean the following: <br>
    we typically refine macromolecular structures using
    maximum-likelihood (ML) target function and not the R-factor.
    Maximizing the ML target does not necessarily mean minimizing the
    R-factor (although free R is correlated with the phase error and the
    latter should improve with the optimization of ML). So what you
    observe is slightly odd but not too unexpected. <br>
    <br>
    This is discussed to some extent here (for example):<br>
    <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.ccp4.ac.uk/newsletters/newsletter37/08_ml.html">http://www.ccp4.ac.uk/newsletters/newsletter37/08_ml.html</a><br>
    <br>
    The other 10+ potential reasons include:<br>
    - suboptimal refinement strategy;<br>
    - target weights may need adjustment;<br>
    - ...<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
    <blockquote
      cite="mid:1327618617.96740.YahooMailNeo@web121703.mail.ne1.yahoo.com"
      type="cite">
      <div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times
        new roman, new york, times, serif;font-size:12pt">
        <div><span>Dear All,</span></div>
        <div><br>
          <span></span></div>
        <div><span>What it means if the Rwork or Rfree increase slightly
            during refinement?</span></div>
        <div><br>
          <span></span></div>
        <div><span>Best regards.</span></div>
        <div><br>
          <span></span></div>
        <div><span>Dialing</span></div>
      </div>
    </blockquote>
  </body>
</html>