Hi Rajesh,<div><br></div><div>Thanks for clarifying, I see now what needs to be added to the PDB header. I&#39;ll add that functionality for when torsion NCS restraints are used.</div><div><br></div><div>Jeff<br><div><br><div class="gmail_quote">

On Fri, Mar 9, 2012 at 8:20 PM, Rajesh kumar <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ccp4_sc@hotmail.com">ccp4_sc@hotmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Dear Pavel,<br>
With global type, it&#39;s written to header but with torsion angle nothing is added to pdb though log file suggests about applying NSC. Except the user nobody will know about the ncs.<br>
Thanks<br>
Rajesh<br>
<br>
Sent from my iPhone<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Mar 9, 2012, at 10:10 PM, &quot;Pavel Afonine&quot; &lt;<a href="mailto:pafonine@lbl.gov">pafonine@lbl.gov</a>&gt; wrote:<br>
<br>
&gt; Hi Jeff,<br>
&gt;<br>
&gt;&gt; This is a great point. There should probably be NCS output in the PDB header.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; yes, it&#39;s definitely good to have, but can we really say more than something like:<br>
&gt;<br>
&gt; REMARK 3 NCS RESTRAINTS: TYPE TORSION<br>
&gt;<br>
&gt; ?<br>
&gt;<br>
&gt;&gt; &gt; 2. What is difference between NCS type, global and torsion angle, and when they are preferred over the other?<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; Global NCS uses Cartesian-based restraints, which force the matching chains to be identical.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Just a minor correction: what you described are NCS *constraints*, and we don&#39;t have them in phenix.refine yet. NCS restraints force the coordinates and B-factors (residual B-factors if TLS is used) of NCS related copies to be *similar* (but not necessarily identical). The degree of similarity is determined by a parameter, and this parameter cannot be set such that NCS restraints become NCS constraints.<br>


&gt;<br>
&gt; All the best,<br>
&gt; Pavel<br>
&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div></div>