<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Hi Matthew,<br>
    <br>
    try <br>
    <br>
    phenix.commands<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
    On 4/3/12 10:55 AM, Matthew J. Whitley wrote:
    <blockquote
      cite="mid:E2AB967A-7FA7-4300-A8E8-39EA5EB4EFF4@structbio.pitt.edu"
      type="cite">Hello all,
      <div><br>
      </div>
      <div>I was wondering if somewhere, either on the web or in
        hardcopy, there is an exhaustive or nearly exhaustive list of
        Phenix commands.</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>For example, from a Phenix BB thread earlier in the day I
        learned of the existence of the phenix.r_factor_statistics
        command for gaining insight into where your R/Rfree values place
        you in regard to structures of similar resolution. &nbsp;As I read
        more of the messages posted to the Phenix BB, I become aware of
        more and more nifty things that Phenix can do that I simply was
        not aware of, and I was wondering if some kind of master list of
        Phenix commands is available somewhere.</div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Thanks to all the developers for making this amazing program
        available to the x-ray community.</div>
      <div><br>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <div><br>
      </div>
      <div>Thanks,</div>
      <div>Matthew</div>
      <div><br>
        <div>
          <span class="Apple-style-span" style="border-collapse:
            separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica;
            font-style: normal; font-variant: normal; font-weight:
            normal; letter-spacing: normal; line-height: normal;
            orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px;
            text-transform: none; white-space: normal; widows: 2;
            word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px;
            -webkit-border-vertical-spacing: 0px;
            -webkit-text-decorations-in-effect: none;
            -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width:
            0px; font-size: medium; ">
            <div><br class="Apple-interchange-newline">
              <br>
            </div>
            <div>---</div>
            Matthew J. Whitley, Ph.D.<br>
            Postdoctoral Research Fellow<br>
            Angela Gronenborn Lab<br>
            Department of Structural Biology<br>
            University of Pittsburgh School of Medicine<br>
          </span></div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>