<font color="#000000"><font>Dear phenix BB,<br><br>I am having an alternate conformation clashing problem that I am having difficulty resolving:<br><br>I have a protein in which the N-terminal residue is in two conformations.When the residue is in the &#39;A&#39; conformation, the sidechain overlaps with the &#39;A&#39; conformation sidechain density of its symmetry mate. I have modeled the occupancy at 50%. However, every time I refine, phenix pushes the &#39;A&#39; conformer out of the density, likely due to clashing with its symmetry mate. <br>
<br>Is there anyway to get around this? <br clear="all"></font></font><br>Thanks in advance,<br><br>Rebecca <br> <br>