<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1">
<div style="direction: ltr;font-family: Helvetica;color: #000000;font-size: 12pt;">
The latter....something more analytical to split individual chains into smaller groups
<br>
(e.g. like to define tls groups).<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Gino<br>
<br>
<div><br>
<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><font style="font-family:Helvetica" size="3">******************************************************************************<br>
Gino Cingolani, Ph.D.<br>
Associate Professor<br>
Thomas Jefferson University<br>
Dept. of Biochemistry &amp; Molecular Biology<br>
233 South 10th Street - Room 826<br>
Philadelphia PA 19107<br>
Office (215) 503 4573<br>
Lab&nbsp;&nbsp;&nbsp; (215) 503 4595<br>
Fax&nbsp;&nbsp;&nbsp; (215) 923 2117<br>
E-mail:&nbsp;&nbsp; gino.cingolani@jefferson.edu<br>
Website:&nbsp; http://www.cingolanilab.org<br>
******************************************************************************<br>
&quot;Nati non foste per viver come bruti, ma per seguir virtute e canoscenza&quot;<br>
(&quot;You were not born to live like brutes, but to follow virtue and knowledge&quot;) Dante,
<br>
The Divine Comedy (Inferno,&nbsp; XXVI, vv. 119-120)<br>
</font><br>
</div>
</div>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div style="direction: ltr;" id="divRpF238421"><font color="#000000" face="Tahoma" size="2"><b>From:</b> phenixbb-bounces@phenix-online.org [phenixbb-bounces@phenix-online.org] on behalf of Nathaniel Echols [nechols@lbl.gov]<br>
<b>Sent:</b> Thursday, July 12, 2012 12:19 PM<br>
<b>To:</b> PHENIX user mailing list<br>
<b>Subject:</b> Re: [phenixbb] segmented rigid body refinement<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>On Thu, Jul 12, 2012 at 9:16 AM, Gino Cingolani <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Gino.Cingolani@jefferson.edu" target="_blank">Gino.Cingolani@jefferson.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<div class="gmail_quote">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
I'm refining a large oligomeric structure at low res (~6A).<br>
I'd like to define groups to use for 'segmented rigid body refinement'.<br>
Is there any rational way to define 'segments'?<br>
My macromolecule is already an oligomer on its own, so, intuitively,<br>
each protomer is a segment.<br>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>Not sure I understand the question - do you mean you want to split the individual chains into smaller groups, and you're looking for an analytical method for determining these groups?</div>
<div><br>
</div>
<div>-Nat</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>