<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:arial"><DIV></DIV>
<DIV>Hi all:<BR>I do not know if someone mentioned this problem here before. Recently I ran the AutoBuild to build the structure model, and it outputs a best model(R/Rfree 0.20/0.24). After that, I tried the program Phenix Refine using the .pdb and .mtz generated by AutoBuild. The R value increased to 0.23/0.30 by the end of this refine.<BR>I wonder why this happened? Or if I have done something wrong?</DIV>
<DIV><BR>(After AutoBuild, I modified the structure and added the substrate moleculars into the structure by hand.</DIV>
<DIV>I thought the increase of the R value was resulted from the inapposite position of the substrates.</DIV>
<DIV>But the R value still increased when I ran the Phenix Refine just by inputting the output of the AutoBuild without any manual modification.)<BR><BR></DIV>
<DIV>--<BR>
<DIV>Tong Huo</DIV>
<DIV>Ph.D candidate</DIV>
<DIV>College of Life Sciences</DIV>
<DIV>Nankai University</DIV>
<DIV>Tianjin, China</DIV></DIV></div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>