<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>Dear Experts</span></div><div><br><span></span></div><div><span>I am <span id="yiv1733061102misspell-0" class="yiv1733061102"><span>refining</span></span>
 my structures in windows mode and every time i got this crash message i
 do not know how to solve this issue? If any one encountered this 
problem kindly suggest me how to solve it. While when i refine with <span id="yiv1733061102misspell-1" class="yiv1733061102mark">refmac</span> the file proceeds smoothly but i want to <span id="yiv1733061102misspell-2" class="yiv1733061102"><span>refinement</span></span> in phenix due to utilize some parameters.</span></div><div><br><span></span></div><span></span><div><span></span> <span>its end like this:<br></span></div><div><br><span></span></div><br><div>Exporting results ==============================<br><br>Writing refined structure to PDB file:<br>&nbsp; C:\Documents and Settings\pc user\Desktop\Refine_2\jbu_refine_2.pdb<br>n_use&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 7514<br>n_use_u_both&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 7514<br>n_use_u_iso&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 0<br>n_use_u_aniso&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 0<br>n_grad_site&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp;
 0<br>n_grad_u_iso&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 0<br>n_grad_u_aniso&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 0<br>n_grad_occupancy
 =&nbsp; 331<br>n_grad_fp&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 0<br>n_grad_fdp&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; =&nbsp; 0<br>total number of scatterers =&nbsp; 7514<br><br>After that its not produce the map file and gave errore crash mesage.<br><div>&nbsp;<img alt="" height="591" width="573"><span></span><font color="#40007f"><span style="color:rgb(0, 0, 0);"><span style="font-weight:bold;"></span></span></font></div></div><span style="font-weight: bold;">&lt;module&gt;</span><br style="font-weight: bold;"><div style="font-weight: bold;">Bus error (Python call stack above)<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  This crash may be due to a problem in any imported<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  Python module, including modules which are not part<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  of the cctbx project. To disable the traps leading<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
 &nbsp; &nbsp; &nbsp;  to this message, define these environment variables<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  (e.g. assign the value 1):<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  BOOST_ADAPTBX_FPE_DEFAULT<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  BOOST_ADAPTBX_SIGNALS_DEFAULT<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  This will NOT solve the problem, just mask it, but<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  may allow you to proceed in case it is not critical.</div><div><font color="#40007f"><br><span style="color: rgb(0, 0, 0);"><span style="font-weight: bold;"></span></span></font><div><span>Your suggestion highly obliged<br></span></div>
<div><br><span></span></div>
<span>I would be very thankful to you</span><font color="#40007f"><span style="color:rgb(0, 0, 0);"><span style="font-weight:bold;"></span></span><br><br style="font-weight:bold;color:rgb(0, 0, 0);"><span style="font-weight:bold;color:rgb(0, 0, 0);">AFSHAN</span><br></font></div><div><font color="#40007f"></font></div><br><div><font color="#40007f"></font></div></div></body></html>