
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body text="#000099" bgcolor="#FFFFFF">

    Hi,<br>

    <br>

    The default minimum distance that a water gets placed near

    protein/water atoms using 'ordered_solvent=true' option in

    phenix.refine is 1.8.<br>

    Isn't this too close?<br>

    <br>

    Also, if two waters can't get placed in the density due to distance

    criterion, can phenix place one water in dual conformations in that

    density?<br>

    <br>

    <div class="moz-signature">-- <br>

      <font size="2" face="Verdana" color="#000099">

        Thanks, <br>

        Abhinav </font>

      <p><font size="2" face="Verdana" color="#000099">

        </font>

        <font size="2" face="Verdana" color="#0099AA">

          JCSG@SSRL, SLAC <br>

          (650) 926-2992 <br>

        </font></p>

    </div>

  </body>

</html>