<div dir="ltr">Or you could have the test specify what version of Rosetta the results were compiled with. It&#39;s a bit opaque right now.<div><br></div><div style>Cheers,</div><div style>Morten</div></div><div class="gmail_extra">
<br><br><div class="gmail_quote">On 7 January 2013 17:43, Terwilliger, Thomas C <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:terwilliger@lanl.gov" target="_blank">terwilliger@lanl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi Morten,<br>
<br>
Yes, you&#39;ve guessed correctly that the regression tests do check the numbers in the output compared to a standard run. In some cases (as the two that you show) some minor change in the algorithms can give &quot;failures&quot; that are just due to small changes in algorithms. �I think you can probably ignore these two errors. I&#39;ll be checking these here and I&#39;ll just have it ignore these differences if they are uninteresting.<br>

<br>
All the best,<br>
Tom T<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Jan 7, 2013, at 6:35 AM, Morten Groftehauge wrote:<br>
<br>
&gt; Hi guys,<br>
&gt;<br>
&gt; I just updated Rosetta to 3.4 and it seems to have compiled correctly (at least no error interruptions). I&#39;ve done this enough to not be satisfied by that and ran<br>
&gt; &gt; phenix_regression.wizards.test_command_line_rosetta_quick<br>
&gt; which goes past the Rosetta tests correctly but fails at<br>
&gt; =================================================================<br>
&gt; Running test_prerefine<br>
&gt; ------------------------------------------------------------<br>
&gt; Numbers do not match: 0.47825 0.53601<br>
&gt; r {{ 0.87799 � 0.06946 �-0.47362}<br>
&gt; � �{-0.02049 � 0.99396 � 0.10779}<br>
&gt; � �{ 0.47825 �-0.08494 � 0.87411}}<br>
&gt; ---<br>
&gt; r {{ 0.84375 � 0.06393 �-0.53291}<br>
&gt; � �{-0.02789 � 0.99676 � 0.07541}<br>
&gt; � �{ 0.53601 �-0.04877 � 0.84280}}<br>
&gt;<br>
&gt; ------------------------------------------------------------<br>
&gt;<br>
&gt; FAILED<br>
&gt; See log files test_prerefine/test_prerefine.log �test_prerefine/test_prerefine_current.log<br>
&gt; =================================================================<br>
&gt; Running test_prerefine_double<br>
&gt; OK<br>
&gt; =================================================================<br>
&gt; Running test_prerefine_no_data<br>
&gt; ------------------------------------------------------------<br>
&gt; Numbers do not match: 0.47825 0.53601<br>
&gt; r {{ 0.87799 � 0.06946 �-0.47362}<br>
&gt; � �{-0.02049 � 0.99396 � 0.10779}<br>
&gt; � �{ 0.47825 �-0.08494 � 0.87411}}<br>
&gt; ---<br>
&gt; r {{ 0.84375 � 0.06393 �-0.53291}<br>
&gt; � �{-0.02789 � 0.99676 � 0.07541}<br>
&gt; � �{ 0.53601 �-0.04877 � 0.84280}}<br>
&gt;<br>
&gt; ------------------------------------------------------------<br>
&gt;<br>
&gt; FAILED<br>
&gt; See log files test_prerefine_no_data/test_prerefine_no_data.log �test_prerefine_no_data/test_prerefine_no_data_current.log<br>
&gt; =================================================================<br>
&gt; When I look in the log there are no error messages. I don&#39;t need to prerefine so I&#39;m good but I still find it weird.<br>
&gt; I tried again with Rosetta 3.3 and got no error flags.<br>
&gt;<br>
&gt; Is it because the quick tests are checking the result against the results that you got earlier and the algorithm has been changed between 3.3 and 3.4?<br>
&gt;<br>
&gt; Cheers,<br>
&gt; Morten<br>
&gt;<br>
&gt; PS Really enjoyed the talks at the CCP4 study weekend.<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; Morten K Gr�ftehauge, PhD<br>
&gt; Pohl Group<br>
&gt; Durham University<br>
</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5">&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Morten K Gr�ftehauge, PhD�<div>Pohl Group</div><div>Durham University</div>
</div>