<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Nat,<div><br></div><div>Yes, I did that.</div><div><br><div>
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div>Best regards,</div><div><br></div><div>Bishwa&nbsp;</div><div><br></div><div><br></div></span><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br><div><div>On Jan 11, 2013, at 6:08 PM, Nathaniel Echols wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div>On Fri, Jan 11, 2013 at 2:07 AM, &nbsp;&lt;<a href="mailto:bsubedi@btk.fi">bsubedi@btk.fi</a>&gt; wrote:<br><blockquote type="cite">I used readyset to obtain the restrains for refinement using .pdb file, even<br></blockquote><blockquote type="cite">though my refinement works, when i try to run real build refine in coot I get<br></blockquote><blockquote type="cite">this error message:<br></blockquote><blockquote type="cite"><br></blockquote><blockquote type="cite">Failed to match (to the dictionary) the following model atom names:<br></blockquote><blockquote type="cite">HB3<br></blockquote><blockquote type="cite">�O6� �C10� �C11� �C12� �O7� �C13� �O5� �C8� �C9� ......<br></blockquote><blockquote type="cite">That would cause exploding atoms, so the refinement didn't start.<br></blockquote><blockquote type="cite"><br></blockquote><blockquote type="cite">Could someone help me with fixing this problem.<br></blockquote><br>Did you load the CIF from ready_set into Coot first? &nbsp;(File menu -&gt;<br>Import CIF dictionary)<br><br>-Nat<br>_______________________________________________<br>phenixbb mailing list<br><a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb<br></div></blockquote></div><br></div></body></html>