<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle">P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
</style>
</head>
<body fPStyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">
<p>Hello,</p>
<p>I can see additional density just next to Cys residues in my protein structure and it looks like BME is covalently linked to cys. I could form a disulfide bond between BME and Cys in &quot;Refmac 5 review restrain&quot; but when i subject it for refinement BME is
 thrown away (no disulfide bond). I also given Cif file in refinement but it didnot help. I have a feel that i am missing something in cif file. Can anyone suggest step&nbsp; by step starting from adding BME to making a link with BME (Cys-BME)&nbsp;and then refinement?</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>Raj</p>
</div>
</body>
</html>