<div dir="ltr">Dear phenixbb.<div><br></div><div>I am currently running phenix 1.8.2-1309. </div><div><br></div><div>My goal is to use group ADP with 2 b-factors per residue for the protein and individual b-factors for solvent. </div>
<div><br></div><div>However, this does not seem to be working even though the system seems to recognise what I want to do. The refinement output gives what looks like individual b-factor refinement...</div><div><br></div>
<div><div>================== Extract refinement strategy and selections =================</div><div><br></div><div>Refinement flags and selection counts:</div><div>  individual_sites       =  True (4048 atoms)</div><div>  torsion_angles         = False (0 atoms)</div>
<div>  rigid_body             = False (0 atoms in 0 groups)</div><div>  individual_adp         =  True (iso = 127 aniso = 0)</div><div>  group_adp              =  True (3921 atoms in 967 groups)</div><div>  tls                    = False (0 atoms in 0 groups)</div>
<div>  occupancies            = False (0 atoms)</div><div>  group_anomalous        = False</div></div><div><br></div><div>In troubleshooting it appears that with Group ADP with 2 b-factors per residue, the solvent B-factors are not being refined, i.e., remaining at the Wilson B that I set previously. For Group ADP with 1 b-factors per residue - everything appears to refine OK.</div>
<div><br></div><div>Any help would be greatly appreciated,</div><div><br></div><div>Regards,</div><div><br></div><div>Joe</div><div><br></div></div>