<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Is it important (or at least useful) to remove any waters before initiating ensemble refinement wherein the waters are located in what is obvious electron density for alternative conformations of side chains? Would the presence of such waters possibly result in ensemble refinement NOT modeling the alternative conformations?<br><div apple-content-edited="true">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 'Lucida Grande'; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 'Lucida Grande'; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: 'Lucida Grande'; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">______________________________________________________________________________________<br>Joseph P. Noel, Ph.D.<br>Arthur and Julie Woodrow Chair</div><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Investigator, Howard Hughes Medical Institute<br>Professor, The Jack H. Skirball Center for Chemical Biology and Proteomics<br>The Salk Institute for Biological Studies<br>10010 North Torrey Pines Road<br>La Jolla, CA &nbsp;92037 USA<br><br>Phone: (858) 453-4100 extension 1442<br>Cell: (858) 349-4700<br>Fax: (858) 597-0855<br>E-mail:&nbsp;<a href="mailto:noel@salk.edu">noel@salk.edu</a><br><br>Publications &amp; Citations: <a href="http://scholar.google.com/citations?user=xiL1lscAAAAJ">http://scholar.google.com/citations?user=xiL1lscAAAAJ</a><div><br>Homepage Salk: <a href="http://www.salk.edu/faculty/noel.html">http://www.salk.edu/faculty/noel.html</a><br>Homepage HHMI: <a href="http://hhmi.org/research/investigators/noel.html">http://hhmi.org/research/investigators/noel.html</a><br>______________________________________________________________________________________</div></div></span></div></span></span>
</div>
<br></body></html>