<div dir="ltr">Are you running refinement to cause the separation? If so, you can try the intra_chain=True option in later version to link the two residues. If that fails send me the files directly.<div><br></div><div>Cheers</div>

<div><div><br></div><div>Nigel</div></div><div><br></div><div>NB. Any files sent to me will be held in strictest confidence.<br><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 20, 2013 at 12:00 PM, Dmitry Rodionov <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:d.rodionov@gmail.com" target="_blank">d.rodionov@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Click Real space refine zone. Then click on your previous residue, then click on the newly added residue.<br>
<br>
<br>
HTH,<br>
� � � � Dmitry<br>
<div><div class="h5"><br>
On 2013-08-20, at 2:53 PM, Heather L Condurso wrote:<br>
<br>
&gt; Dear all,<br>
&gt;<br>
&gt; I have been trying to add a residue to my model in coot for hours now. �The add terminal residue function adds a residue far from the end of my chain and I&#39;ve tried moving it manually and it keeps going back and it never makes a bond between the two amino acids. �Is there a trick in coot or a better way to do this in phenix?<br>


&gt;<br>
&gt; Thanks,<br>
&gt; Heather Condurso<br>
&gt; UF-Department of Chemistry<br>
</div></div>&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br>
<br>_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Nigel W. Moriarty<br>Building 64R0246B, Physical Biosciences Division<br>Lawrence Berkeley National Laboratory<br>Berkeley, CA 94720-8235<br>Phone : 510-486-5709� �� Email : NWMoriarty@LBL.gov<br>

Fax�� : 510-486-5909� � �� Web� : <a href="http://CCI.LBL.gov">CCI.LBL.gov</a>
</div>