<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
I have two questions about which structure factor amplitudes are refined against in phenix.refine. &nbsp;
<div><br>
</div>
<div>1. Which structure factor amplitude is used in refinement when the labels in the .def file are the following? &nbsp;
<div><br>
</div>
<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; labels = &quot;F-obs(&#43;),SIGF-obs(&#43;),F-obs(-),SIGF-obs(-)&quot;</div>
<div><br>
</div>
<div>2. Is anomalous data used in the refinement when the&nbsp;labels&nbsp;are as follows?</div>
<div><br>
</div>
<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; labels = &quot;F,SIGF,DANO,SIGDANO,ISYM&quot;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I ask these questions because I am wondering which structure factor amplitudes to deposit, and I am trying to rationalize differences between R-factors from refinement and Generate Table 1. &nbsp;</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks.</div>
<div><br>
</div>
<div>Jack Tanner</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<br>
<br>
<div apple-content-edited="true">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<div>John J. Tanner<br>
Professor of&nbsp;Biochemistry&nbsp;and&nbsp;Chemistry</div>
<div>University of Missouri-Columbia<br>
125 Chemistry Building<br>
Columbia, MO 65211<br>
Phone: 573-884-1280<br>
Fax: 573-882-2754<br>
Email:&nbsp;<a href="mailto:tannerjj@missouri.edu">tannerjj@missouri.edu</a><br>
<a href="http://faculty.missouri.edu/~tannerjj/tannergroup/tanner.html">http://faculty.missouri.edu/~tannerjj/tannergroup/tanner.html</a></div>
</div>
</div>
</div>
<br>
</div>
</body>
</html>