<div dir="ltr">On Tue, Dec 3, 2013 at 10:54 PM, Jobichen Chacko <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jobichenc@gmail.com" target="_blank">jobichenc@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I recently upgraded to latest version of coot (version0.7.2). When I<br>
try to do the Real space refine zone option, coot is giving the<br>
following complaint (Refinement setup failure. Failed to find<br>
restraints for PROLYSILE).<br>
<br>
But it works fine when I open coot separately from a terminal and read<br>
the pdb and mtz file.<br></blockquote><div><br></div><div>Phenix will instruct Coot to load user-provided CIF files, but I didn&#39;t think we interfere with Coot&#39;s own restraints otherwise. �Can you please send me the console output of Coot a) when launched from Phenix b) when launched by itself?</div>

<div><br></div><div>-Nat</div></div></div></div>